More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1323 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1323  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
451 aa  892    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.120017 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3218  Adenylosuccinate synthase  67.97 
 
 
461 aa  625  1e-178  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1057  Adenylosuccinate synthase  66.16 
 
 
454 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0047  adenylosuccinate synthetase  65.73 
 
 
462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2175  adenylosuccinate synthetase  63.98 
 
 
464 aa  581  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0692  adenylosuccinate synthetase  64.5 
 
 
467 aa  578  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  44.47 
 
 
429 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  45.15 
 
 
430 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  45.33 
 
 
429 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  44.7 
 
 
430 aa  374  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  44.7 
 
 
428 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  44 
 
 
439 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 
439 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 
436 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  43.9 
 
 
436 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  45.27 
 
 
427 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  43.68 
 
 
428 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  45.27 
 
 
427 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  43.11 
 
 
436 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  45.15 
 
 
427 aa  364  1e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  44.24 
 
 
428 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  43.02 
 
 
424 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  44.47 
 
 
430 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 
436 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  46.36 
 
 
429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  46.36 
 
 
429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  46.36 
 
 
429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  46.36 
 
 
429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  43.72 
 
 
426 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 
439 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  45.05 
 
 
533 aa  359  5e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  44.79 
 
 
429 aa  359  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  43.68 
 
 
429 aa  359  7e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  44.54 
 
 
427 aa  359  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  44.47 
 
 
429 aa  359  7e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  44.57 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  42.89 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  41.78 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  44.08 
 
 
430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  43.82 
 
 
427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  41.85 
 
 
444 aa  356  5e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  43.83 
 
 
433 aa  354  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  43.08 
 
 
430 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  41.69 
 
 
447 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  46.14 
 
 
429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  46.36 
 
 
429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  41.7 
 
 
442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  42.34 
 
 
427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  46.22 
 
 
439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  44.8 
 
 
433 aa  353  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  45.23 
 
 
429 aa  353  4e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  45.68 
 
 
429 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  44.49 
 
 
432 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  46.36 
 
 
429 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  43.21 
 
 
434 aa  353  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1126  adenylosuccinate synthetase  44.79 
 
 
436 aa  353  5e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00711413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  45.15 
 
 
432 aa  352  5.9999999999999994e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  46.14 
 
 
429 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  43.17 
 
 
431 aa  352  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  44.07 
 
 
427 aa  352  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  45.25 
 
 
434 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1460  adenylosuccinate synthetase  43.67 
 
 
427 aa  351  2e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  42.38 
 
 
434 aa  350  3e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  42.51 
 
 
427 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  44.71 
 
 
432 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  45.18 
 
 
432 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  42.38 
 
 
431 aa  350  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  42.26 
 
 
427 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  45.18 
 
 
432 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  44.96 
 
 
432 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  40.67 
 
 
437 aa  349  6e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  40.67 
 
 
437 aa  349  6e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  43.3 
 
 
426 aa  348  9e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  45.7 
 
 
429 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  44.71 
 
 
432 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  44.71 
 
 
430 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  44.2 
 
 
427 aa  345  8e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  42.22 
 
 
447 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  43.46 
 
 
427 aa  345  8.999999999999999e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  45.7 
 
 
430 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  42.22 
 
 
447 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0667  adenylosuccinate synthetase  44.24 
 
 
429 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  41.44 
 
 
424 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  44.04 
 
 
430 aa  344  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0522  adenylosuccinate synthetase  44.37 
 
 
429 aa  344  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  43.24 
 
 
432 aa  343  4e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  43.61 
 
 
430 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  42.53 
 
 
434 aa  342  7e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  44.35 
 
 
429 aa  342  7e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  43.93 
 
 
431 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  40.31 
 
 
444 aa  342  7e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  42.51 
 
 
432 aa  342  8e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  42.31 
 
 
434 aa  342  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  45.05 
 
 
429 aa  341  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  41.7 
 
 
451 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  42.95 
 
 
430 aa  340  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  43.61 
 
 
430 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  41.33 
 
 
428 aa  341  2e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  44.93 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  42.47 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0290835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>