More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1426 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1426  response regulator receiver protein  100 
 
 
288 aa  590  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  41.28 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  41.44 
 
 
298 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  41.05 
 
 
302 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  39.58 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  39.93 
 
 
300 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  40.07 
 
 
294 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  38 
 
 
318 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5232  response regulator receiver protein  38.99 
 
 
294 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0150  response regulator receiver protein  37.67 
 
 
300 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5371  response regulator receiver protein  38.71 
 
 
296 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5324  response regulator receiver protein  38.35 
 
 
296 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4402  response regulator receiver protein  37.06 
 
 
280 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  37.89 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  43.7 
 
 
127 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  46.9 
 
 
130 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  41.6 
 
 
129 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  41.6 
 
 
129 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  41.86 
 
 
129 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  40.8 
 
 
129 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
131 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  40.8 
 
 
129 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
131 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
131 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
131 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
131 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
131 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
131 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
131 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  40.16 
 
 
131 aa  99.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
131 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
131 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
131 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
131 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
131 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  40.16 
 
 
131 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
188 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  39.71 
 
 
132 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  39.2 
 
 
129 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  40 
 
 
129 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  39.2 
 
 
129 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  39.2 
 
 
129 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  39.2 
 
 
129 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  39.2 
 
 
129 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
131 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  41.13 
 
 
131 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  40 
 
 
129 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  40 
 
 
129 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  40.98 
 
 
131 aa  96.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  40 
 
 
129 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  40 
 
 
129 aa  96.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  39.37 
 
 
131 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  40 
 
 
148 aa  95.9  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  40.5 
 
 
133 aa  95.5  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  39.2 
 
 
129 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  39.2 
 
 
129 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  39.2 
 
 
129 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  39.2 
 
 
129 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  39.2 
 
 
129 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  36.15 
 
 
128 aa  95.5  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  39.2 
 
 
129 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  39.2 
 
 
129 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  39.2 
 
 
129 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  39.2 
 
 
129 aa  95.5  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  38.58 
 
 
127 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  38.58 
 
 
127 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  40.34 
 
 
130 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  40.17 
 
 
127 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  38.1 
 
 
137 aa  94  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  40.34 
 
 
130 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
928 aa  93.2  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  38.58 
 
 
127 aa  93.2  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  38.89 
 
 
131 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  37.3 
 
 
127 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  37.61 
 
 
128 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
126 aa  92.4  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
1127 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  37.9 
 
 
135 aa  91.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  37.8 
 
 
127 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  38.58 
 
 
130 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
126 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
1098 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
126 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  37.17 
 
 
126 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  38.58 
 
 
126 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
126 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 
127 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
1098 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
122 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
126 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  33.85 
 
 
128 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  37.6 
 
 
131 aa  89.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  36.22 
 
 
127 aa  89.7  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  36.22 
 
 
127 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  36.22 
 
 
127 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  36.22 
 
 
127 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  36.22 
 
 
127 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  36.22 
 
 
127 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  36.22 
 
 
127 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
126 aa  89.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>