34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1356 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1501  hypothetical protein  39.49 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000010842  normal  0.0102039 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  31.68 
 
 		 185 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2181  hypothetical protein  25.89 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.498275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  35.76 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  32.45 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37393  predicted protein  29.79 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.392699  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35472  predicted protein  29.79 
 
 		 228 aa  57  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176314  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  27.64 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  32.21 
 
 		 257 aa  52  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  33.33 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  31.25 
 
 		 251 aa  51.6  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  32.47 
 
 		 165 aa  51.2  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  31.65 
 
 		 273 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  26.19 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  31.48 
 
 		 247 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  29.13 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  26.57 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  38.57 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  29.79 
 
 		 265 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  32.86 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0782  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138786  normal  0.0233104 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2340  methyltransferase small  32.46 
 
 		 333 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.271786 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1705  putative RNA methylase  29.71 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  38.46 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  30.52 
 
 		 265 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  27.52 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0975  hypothetical protein  34.72 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.753876 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0685  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  32.46 
 
 		 333 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0545  methyltransferase small  31.93 
 
 		 333 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  32.28 
 
 		 148 aa  41.6  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  25.53 
 
 		 174 aa  42  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 247 aa  41.6  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>