278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0197 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0197  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 362 aa  706    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0279028  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  61.13 
 
 		 515 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1411  sodium/bile acid symporter family protein  61.93 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.618786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2603  Bile acid:sodium symporter  60.56 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000713647  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0627  bile acid:sodium symporter  63.03 
 
 		 333 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1293  Bile acid:sodium symporter  59.25 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1578  arsenite efflux pump ACR3 and related permeases  56.92 
 
 		 323 aa  336  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1934  bile acid:sodium symporter  55.35 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0408  sodium/bile acid symporter family protein  54.09 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2303  Bile acid:sodium symporter  54.85 
 
 		 334 aa  302  6.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000645275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03690  Bile acid:sodium symporter  35.16 
 
 		 315 aa  176  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  32.08 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0693  Bile acid:sodium symporter  31.04 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  30.98 
 
 		 357 aa  99.8  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  28.34 
 
 		 377 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  28.67 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  29.1 
 
 		 367 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  29.47 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  30.56 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  27.81 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  30.92 
 
 		 348 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  29.24 
 
 		 358 aa  89.4  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  29.25 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  28.24 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  27.84 
 
 		 360 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  27.51 
 
 		 367 aa  85.9  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1026  arsenite transporter-like permease, ACR3 family  26.37 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000872281  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  28.67 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  28.96 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  28 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  25.75 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  23.16 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  29.41 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  23.16 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  25.48 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  23.16 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  27.81 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0172  Bile acid:sodium symporter  25.95 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0310359  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  28.15 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  23.34 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  31.06 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  24.13 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  26.49 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  27.24 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  25.57 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  23 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  26.97 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1054  arsenical-resistance protein  25.6 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0721949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  23 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  23 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  24.15 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  28.4 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  23 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  23 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  23 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4722  arsenical-resistance protein  29.36 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  24.52 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0911  arsenical-resistance protein  24.91 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  0.11905 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  24.62 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  27.12 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  26.74 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  24.14 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  22.65 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  27.63 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  22.65 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  27.63 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  27.63 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  24.81 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  26.59 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  23.34 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  27.63 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  27.63 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  24.55 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  24.35 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  26.54 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1733  arsenical-resistance protein, putative  22.4 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126518  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  26.34 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  23.53 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  27.57 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  27.24 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  22.78 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  27.24 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  26.92 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  28 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1095  arsenite efflux pump  26.64 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000341702  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  24.18 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  30.23 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  24.18 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  24.34 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  24.72 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3465  arsenical-resistance protein  28.95 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  28.32 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  23.95 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  23.91 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  23.28 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00490  Arsenical-resistance protein  24.48 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.137298  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  26.8 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0457  bile acid:sodium symporter  24.23 
 
 		 327 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  24.34 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>