More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4263 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4263  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
396 aa  825    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1206  cysteinyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
392 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4315  cysteinyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 
401 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3331  cysteinyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
401 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.552746  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2860  cysteinyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
400 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000103148  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
472 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1230  Cysteine--tRNA ligase  46.59 
 
 
372 aa  325  7e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
457 aa  324  2e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
458 aa  323  3e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
457 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
455 aa  313  3.9999999999999997e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
478 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
459 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 
466 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 
466 aa  302  9e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
500 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2287  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  42.49 
 
 
414 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000304997  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1932  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  45.3 
 
 
403 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5399  cysteinyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
427 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139344  normal  0.289642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
461 aa  299  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
481 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
474 aa  297  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4892  cysteinyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
444 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00699487  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
460 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
461 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
461 aa  296  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
466 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
476 aa  295  9e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
460 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2628  cysteinyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
397 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
459 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
461 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
461 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
465 aa  293  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
459 aa  293  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
461 aa  293  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
498 aa  293  5e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
456 aa  292  7e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
461 aa  292  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 
466 aa  292  8e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
461 aa  292  9e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
459 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
461 aa  292  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
459 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
493 aa  292  9e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
461 aa  292  9e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
459 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  41.01 
 
 
461 aa  292  9e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
461 aa  292  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
461 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
461 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
460 aa  291  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
460 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
485 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
459 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
459 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
459 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
461 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
465 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
459 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
459 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
485 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
461 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 
454 aa  290  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
456 aa  289  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5930  Cysteine--tRNA ligase  40.97 
 
 
407 aa  289  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
461 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
461 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
461 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
461 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
461 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
484 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
499 aa  288  1e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
484 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
459 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
478 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2010  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  41.16 
 
 
415 aa  286  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
484 aa  286  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
468 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
460 aa  285  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1832  cysteinyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
412 aa  285  8e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
486 aa  285  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
494 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
460 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
489 aa  283  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
481 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
459 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
465 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
460 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  38 
 
 
462 aa  281  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
461 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
493 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
463 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
460 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
461 aa  280  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 
486 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>