100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3239 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3239  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  244  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.641232  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3702  protein of unknown function DUF343  54.39 
 
 
115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4415  hypothetical protein  53.1 
 
 
121 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.527065  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3442  hypothetical protein  54.87 
 
 
119 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0862353  normal  0.0858474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1058  hypothetical protein  49.23 
 
 
60 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657355  normal  0.784499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  35.05 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  48.21 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  44.26 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3709  hypothetical protein  44.44 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  47.27 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3665  hypothetical protein  44.44 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  42.03 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  50 
 
 
58 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  41.54 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  47.06 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  47.06 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  47.17 
 
 
61 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  47.06 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2390  protein of unknown function DUF343  45 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0302108  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  47.17 
 
 
61 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  45.31 
 
 
65 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  38.81 
 
 
68 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  45.1 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  49.02 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  43.94 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  46.43 
 
 
62 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  45.1 
 
 
64 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  45.1 
 
 
64 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  45.1 
 
 
64 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  46.43 
 
 
71 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  45.45 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  46.67 
 
 
58 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  45.45 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  45.45 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  45.45 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  40.3 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  47.06 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  47.06 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  47.06 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2528  protein of unknown function DUF343  40.3 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.44 
 
 
430 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  40.62 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  41.38 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0650  protein of unknown function DUF343  38.98 
 
 
60 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0490  hypothetical protein  38.98 
 
 
60 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.768534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  48 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  43.64 
 
 
57 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  38.89 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  43.4 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  45.1 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  46 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  45.1 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  41.67 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  45.1 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  45.1 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  45.1 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  45.1 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  45.1 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  49.02 
 
 
58 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  41.51 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3840  hypothetical protein  46.81 
 
 
60 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739989  normal  0.0432381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  42.59 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  38.46 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  42.59 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3004  hypothetical protein  43.4 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  44.44 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2975  hypothetical protein  43.4 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331956  normal  0.0195637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2960  hypothetical protein  43.4 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  43.14 
 
 
59 aa  43.9  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  41.82 
 
 
56 aa  43.9  0.0009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2731  hypothetical protein  48.28 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923353  normal  0.0512047 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  47.37 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  41.07 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  43.64 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3515  hypothetical protein  42.59 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1782  hypothetical protein  44.9 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.188644  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  47.06 
 
 
60 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4588  hypothetical protein  42.59 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.658837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3299  hypothetical protein  44.44 
 
 
71 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448781  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  39.29 
 
 
56 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4243  hypothetical protein  36.21 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  41.38 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  45.45 
 
 
57 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2257  hypothetical protein  38.98 
 
 
58 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523879  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2369  hypothetical protein  38.33 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.77429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  44.9 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5857  hypothetical protein  38.18 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768237  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  39.68 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  39.22 
 
 
57 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  36.07 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  36.07 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  40.82 
 
 
60 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  45.28 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  35.94 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  41.82 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2153  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.286356  normal  0.313374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>