46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3702 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3702  protein of unknown function DUF343  100 
 
 
115 aa  234  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4415  hypothetical protein  70.94 
 
 
121 aa  154  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.527065  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3442  hypothetical protein  71.3 
 
 
119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0862353  normal  0.0858474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3239  hypothetical protein  54.39 
 
 
119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.641232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1058  hypothetical protein  58 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657355  normal  0.784499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  44.07 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  42.86 
 
 
56 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  45.16 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  38.89 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  45.16 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  43.08 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  40.98 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  40.98 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  42.59 
 
 
58 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  40.98 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  40.98 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2528  protein of unknown function DUF343  44.07 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  44.07 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  44.64 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3709  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  43.4 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  39.34 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  38.71 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  48.21 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  40.62 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  44.64 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  44.07 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  42.37 
 
 
61 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  42.11 
 
 
61 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.68 
 
 
430 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  44.07 
 
 
61 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  36.62 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1782  hypothetical protein  44 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.188644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  43.86 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  42.59 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  41.51 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  44.23 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  41.38 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  35.38 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2390  protein of unknown function DUF343  38.81 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0302108  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  43.4 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  39.68 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  39.68 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4297  protein of unknown function DUF343  38.24 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.925532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>