50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4415 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4415  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  237  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.527065  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3442  hypothetical protein  90.08 
 
 		 119 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0862353  normal  0.0858474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3702  protein of unknown function DUF343  71.79 
 
 		 115 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317939 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3239  hypothetical protein  53.45 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.641232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  50.85 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1058  hypothetical protein  56 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657355  normal  0.784499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  44.83 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  46.77 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  46.77 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  42.86 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  42.59 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  43.75 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  41.94 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  48.21 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  43.48 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  41.67 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  41.27 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  45.28 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3709  hypothetical protein  37.7 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3665  hypothetical protein  39.29 
 
 		 61 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  48 
 
 		 61 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2731  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923353  normal  0.0512047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.75 
 
 		 430 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  37.88 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  37.14 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  43.4 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1782  hypothetical protein  40.74 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.188644  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  36.23 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2528  protein of unknown function DUF343  36.51 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  36.51 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  40.35 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2390  protein of unknown function DUF343  40.3 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0302108  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  44.9 
 
 		 63 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  44.23 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  44.44 
 
 		 67 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  46 
 
 		 61 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  48 
 
 		 61 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  40.35 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  44.44 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  43.1 
 
 		 58 aa  40.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  35.38 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3156  hypothetical protein  42.11 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.733102  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  39.62 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  39.68 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  36.92 
 
 		 63 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>