More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0913 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0913  methionine adenosyltransferase  100 
 
 		 405 aa  829    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1963  S-adenosylmethionine synthetase  76.62 
 
 		 406 aa  616  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  61.44 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  61.19 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  57.61 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1853  S-adenosylmethionine synthetase  60.65 
 
 		 399 aa  466  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0451389  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  61.25 
 
 		 395 aa  461  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  58.65 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  57.25 
 
 		 403 aa  461  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  56.28 
 
 		 395 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  56.11 
 
 		 403 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  60 
 
 		 397 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1718  S-adenosylmethionine synthetase  61.22 
 
 		 400 aa  458  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  60.25 
 
 		 403 aa  460  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  57.46 
 
 		 414 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1315  S-adenosylmethionine synthetase  58.75 
 
 		 398 aa  461  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119396  normal  0.284127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  59.95 
 
 		 400 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  60.3 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  53.83 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 395 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  59.9 
 
 		 397 aa  454  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  57.14 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  53.83 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2045  S-adenosylmethionine synthetase  59.35 
 
 		 407 aa  455  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  56.25 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12750  methionine adenosyltransferase  59.01 
 
 		 405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0223394 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  53.83 
 
 		 396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  56.33 
 
 		 396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  59.19 
 
 		 407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  55.04 
 
 		 401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  55.09 
 
 		 395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  55.09 
 
 		 395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  55.25 
 
 		 395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  59.95 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  58.46 
 
 		 398 aa  448  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  56.25 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  56.5 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  58.1 
 
 		 403 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3737  S-adenosylmethionine synthetase  56.37 
 
 		 402 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  58.42 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  55.75 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  55.75 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  55.75 
 
 		 399 aa  448  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  54.07 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  56.14 
 
 		 395 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  59.75 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2439  S-adenosylmethionine synthetase  59.64 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  59.25 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  53.73 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  55.83 
 
 		 398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  58.96 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  59.75 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  56 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  56 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  56 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  57.11 
 
 		 403 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  55.03 
 
 		 396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  55.75 
 
 		 405 aa  444  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  56.69 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  56 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  56 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  55.5 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  59.49 
 
 		 399 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  56 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  58.13 
 
 		 398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 400 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2414  S-adenosylmethionine synthetase  56.86 
 
 		 402 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  57.82 
 
 		 398 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2373  S-adenosylmethionine synthetase  56.86 
 
 		 402 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2420  S-adenosylmethionine synthetase  56.86 
 
 		 402 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  54.68 
 
 		 405 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  55.36 
 
 		 402 aa  438  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  56.03 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  54.57 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  56.93 
 
 		 411 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  56.42 
 
 		 397 aa  438  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14830  methionine adenosyltransferase  57.07 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000117882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2993  S-adenosylmethionine synthetase  56.86 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  54.5 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  54.5 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  58.29 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2670  S-adenosylmethionine synthetase  55.15 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  54.8 
 
 		 393 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  54.59 
 
 		 395 aa  431  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  54.77 
 
 		 393 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1993  S-adenosylmethionine synthetase  56.93 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306332 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  53.77 
 
 		 396 aa  431  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12520  methionine adenosyltransferase  54.98 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260949  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  54.7 
 
 		 389 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  55.5 
 
 		 396 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  51.98 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  55.16 
 
 		 382 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  53.63 
 
 		 384 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  53.63 
 
 		 384 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  53.63 
 
 		 384 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  53.63 
 
 		 384 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  52.39 
 
 		 395 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  53.1 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  53.63 
 
 		 384 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>