More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2045 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2045  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
407 aa  816    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00317671 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1315  S-adenosylmethionine synthetase  70.18 
 
 
398 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119396  normal  0.284127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1853  S-adenosylmethionine synthetase  73.57 
 
 
399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0451389  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1718  S-adenosylmethionine synthetase  73.26 
 
 
400 aa  566  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  71.61 
 
 
397 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  71.57 
 
 
399 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  70.28 
 
 
396 aa  539  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  68.42 
 
 
397 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  68.7 
 
 
399 aa  531  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  69.17 
 
 
399 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  68.96 
 
 
399 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  69.62 
 
 
395 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  68.17 
 
 
397 aa  526  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  68.59 
 
 
398 aa  522  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  67.84 
 
 
397 aa  524  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  68.35 
 
 
395 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  68.43 
 
 
417 aa  518  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  69.44 
 
 
401 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  68.53 
 
 
407 aa  514  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  69.8 
 
 
400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  67.51 
 
 
411 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1993  S-adenosylmethionine synthetase  67.26 
 
 
411 aa  512  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  69.04 
 
 
403 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12750  methionine adenosyltransferase  67.08 
 
 
405 aa  513  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0223394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  68 
 
 
397 aa  511  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  68.38 
 
 
399 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  67.17 
 
 
400 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2993  S-adenosylmethionine synthetase  66 
 
 
401 aa  501  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  67.17 
 
 
398 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  65.84 
 
 
398 aa  500  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  65.59 
 
 
403 aa  495  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2439  S-adenosylmethionine synthetase  67.27 
 
 
396 aa  494  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2414  S-adenosylmethionine synthetase  65.59 
 
 
402 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295636  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2373  S-adenosylmethionine synthetase  65.59 
 
 
402 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14830  methionine adenosyltransferase  66.16 
 
 
402 aa  492  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000117882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2420  S-adenosylmethionine synthetase  65.59 
 
 
402 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12520  methionine adenosyltransferase  63.75 
 
 
420 aa  488  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260949  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3737  S-adenosylmethionine synthetase  64.09 
 
 
402 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2670  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 
402 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178907  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  58.19 
 
 
403 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  58.93 
 
 
395 aa  462  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  58.93 
 
 
395 aa  462  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 
396 aa  464  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  59.29 
 
 
403 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  60.3 
 
 
397 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  57.91 
 
 
396 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  58.33 
 
 
397 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  58.33 
 
 
396 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  59.44 
 
 
395 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  57.95 
 
 
396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  58.57 
 
 
399 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  58.82 
 
 
399 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  58.57 
 
 
399 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  58.57 
 
 
399 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  58.57 
 
 
399 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  57.14 
 
 
395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  58.82 
 
 
399 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 
393 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  58.46 
 
 
402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  58.57 
 
 
399 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  55.75 
 
 
401 aa  449  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  56.85 
 
 
396 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  58.57 
 
 
399 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  58.73 
 
 
402 aa  449  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  58.57 
 
 
399 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  58.27 
 
 
414 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  57.14 
 
 
403 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  57.95 
 
 
385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  58.21 
 
 
395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  58.72 
 
 
396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  58.31 
 
 
399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  56.49 
 
 
396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  57.36 
 
 
395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  60.15 
 
 
408 aa  445  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  55.67 
 
 
399 aa  442  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 
389 aa  441  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1306  S-adenosylmethionine synthetase  59.22 
 
 
421 aa  442  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.883498  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  57.8 
 
 
399 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  58.21 
 
 
390 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 
384 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  57.69 
 
 
395 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  55.42 
 
 
398 aa  438  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  58.82 
 
 
382 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 
384 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  55.42 
 
 
398 aa  438  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  59.09 
 
 
397 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  56.74 
 
 
384 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  55.33 
 
 
395 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  54.48 
 
 
396 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  56.42 
 
 
388 aa  436  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  56.74 
 
 
384 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  57.25 
 
 
384 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  56.74 
 
 
384 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  56.68 
 
 
388 aa  437  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  56.74 
 
 
384 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  56.74 
 
 
384 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  56.74 
 
 
384 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  56.74 
 
 
384 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  56.74 
 
 
384 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  56.74 
 
 
384 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>