More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0146 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29570  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70 
 
 		 548 aa  763    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10010  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  74.31 
 
 		 543 aa  815    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.564506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1919  ATP synthase F1, alpha subunit  64.44 
 
 		 542 aa  711    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.086846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.88 
 
 		 544 aa  739    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1125  F0F1 ATP synthase subunit alpha  84.95 
 
 		 543 aa  918    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.826073  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1268  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.8 
 
 		 552 aa  780    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3632  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.21 
 
 		 550 aa  729    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2409  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.23 
 
 		 547 aa  788    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2450  ATP synthase F1, alpha subunit  73.81 
 
 		 543 aa  808    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2316  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.97 
 
 		 548 aa  751    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.48 
 
 		 544 aa  796    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1022  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.64 
 
 		 553 aa  732    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1253  ATP synthase F1, alpha subunit  64.65 
 
 		 544 aa  706    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0274043  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.9 
 
 		 550 aa  736    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000699734 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0146  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 		 553 aa  1127    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.445327 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08160  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.43 
 
 		 555 aa  749    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2340  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.39 
 
 		 545 aa  768    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3918  ATP synthase F1, alpha subunit  70.04 
 
 		 546 aa  783    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1669  H(+)-transporting two-sector ATPase  69.67 
 
 		 549 aa  760    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0334  ATP synthase F1, alpha subunit  71.54 
 
 		 546 aa  773    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6138  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.52 
 
 		 548 aa  735    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3709  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.28 
 
 		 552 aa  724    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11335  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.14 
 
 		 549 aa  734    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1776  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.47 
 
 		 543 aa  822    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.984214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1070  ATP synthase F1, alpha subunit  73.94 
 
 		 542 aa  815    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3878  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.24 
 
 		 548 aa  737    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18220  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.68 
 
 		 549 aa  763    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.850315  normal  0.256257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19150  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.67 
 
 		 541 aa  780    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4138  ATP synthase F1, alpha subunit  65.75 
 
 		 545 aa  737    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1314  ATP synthase F1 subunit alpha  66.03 
 
 		 545 aa  694    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3864  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.24 
 
 		 548 aa  737    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283904  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2124  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.91 
 
 		 547 aa  735    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00337947  hitchhiker  0.00781719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0898  ATP synthase F1 subunit alpha  70.06 
 
 		 549 aa  780    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2607  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.13 
 
 		 545 aa  762    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197618  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0651  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.96 
 
 		 554 aa  750    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.310941  normal  0.421508 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1761  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.84 
 
 		 547 aa  771    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.24 
 
 		 548 aa  737    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0936185  hitchhiker  0.00501194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4330  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.06 
 
 		 548 aa  734    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930948  normal  0.0279627 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.78 
 
 		 507 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.59 
 
 		 507 aa  595  1e-169  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.05 
 
 		 503 aa  588  1e-167  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.05 
 
 		 503 aa  588  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  59.47 
 
 		 508 aa  586  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  55.94 
 
 		 541 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.41 
 
 		 502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  56.39 
 
 		 501 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.61 
 
 		 502 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.92 
 
 		 509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.56 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.8 
 
 		 510 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.41 
 
 		 526 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  59.79 
 
 		 504 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.58 
 
 		 502 aa  572  1.0000000000000001e-162  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.39 
 
 		 509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.59 
 
 		 510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.59 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.38 
 
 		 509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.34 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.68 
 
 		 501 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.23 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.8 
 
 		 510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.61 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.21 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.61 
 
 		 502 aa  570  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.29 
 
 		 501 aa  570  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.35 
 
 		 505 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.61 
 
 		 502 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.61 
 
 		 502 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.61 
 
 		 502 aa  570  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.61 
 
 		 502 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.61 
 
 		 502 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.39 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.14 
 
 		 506 aa  570  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.99 
 
 		 509 aa  571  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  55.8 
 
 		 501 aa  570  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.61 
 
 		 502 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.97 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  55.81 
 
 		 507 aa  570  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.8 
 
 		 510 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.61 
 
 		 502 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.8 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.61 
 
 		 502 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.3 
 
 		 509 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.21 
 
 		 501 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.2 
 
 		 506 aa  571  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.8 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.36 
 
 		 510 aa  569  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.94 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.39 
 
 		 503 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.64 
 
 		 526 aa  565  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  58.09 
 
 		 509 aa  566  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  55.36 
 
 		 502 aa  565  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.71 
 
 		 505 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21420  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  55.98 
 
 		 520 aa  567  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.88 
 
 		 509 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.09 
 
 		 502 aa  566  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.31 
 
 		 504 aa  566  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.62 
 
 		 505 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  60.04 
 
 		 501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  55.75 
 
 		 506 aa  563  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>