More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4215 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 		 146 aa  300  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  77.24 
 
 		 147 aa  231  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  73.79 
 
 		 146 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  72.3 
 
 		 145 aa  217  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  69.18 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  70.27 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  68.49 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  57.43 
 
 		 147 aa  166  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.74 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.48 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.05 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.98 
 
 		 147 aa  157  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.42 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.01 
 
 		 145 aa  150  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.34 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  50 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2285  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.95 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.41 
 
 		 142 aa  143  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.32 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  50 
 
 		 135 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  50 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.68 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.95 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.37 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  47.2 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  48.68 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.01 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.63 
 
 		 145 aa  136  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.69 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.32 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.3 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.31 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.68 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  48.03 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  43.62 
 
 		 152 aa  133  7.000000000000001e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1066  flagellar basal body rod protein FlgC  40.94 
 
 		 164 aa  133  7.000000000000001e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  42.69 
 
 		 164 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  42.11 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  46.5 
 
 		 155 aa  131  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  43.75 
 
 		 164 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1654  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.52 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  50 
 
 		 137 aa  130  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.25 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1403  flagellar basal body rod protein FlgC  40.94 
 
 		 164 aa  128  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4152  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.44 
 
 		 176 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.9 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.9 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.22 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0692  flagellar basal body rod protein FlgC  41.42 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  48 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.54 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1213  flagellar basal body rod protein FlgC  39.74 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  46.21 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2461  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.78 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0105073  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.05 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1396  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.78 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00396064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2557  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.78 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.1 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.21 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.07 
 
 		 139 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2526  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.76 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1387  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.66 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.89 
 
 		 134 aa  113  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  41.1 
 
 		 138 aa  113  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  43.84 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.31 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  38.62 
 
 		 141 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  38.62 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  38.62 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  38.62 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  38.62 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.19 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  38.62 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  38.62 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  40.54 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.1 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  38.62 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  41.1 
 
 		 135 aa  110  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  37.67 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.41 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.84 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  43.24 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  40.41 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  43.24 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1791  flagellar basal body rod protein FlgC  39.73 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  43.24 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.18 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.47 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.47 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.73 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  37.93 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  42.57 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.57 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  42.57 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  42.57 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  42.57 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  42.57 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  42.57 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>