More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1400 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  332  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1369  transcriptional regulator, MerR family  56.67 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000004274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1329  transcriptional regulator, MerR family  52.85 
 
 		 142 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000199488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2844  transcriptional regulator, MerR family  55 
 
 		 134 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2954  transcriptional regulator, MerR family  52.03 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  29.46 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  36.75 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  36.75 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  34.74 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  28.81 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.25 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4984  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  36.89 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5993  MerR family transcriptional regulator  33 
 
 		 140 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000699442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  31.48 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  30.15 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  40.91 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  36.89 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  29.63 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  31.3 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  29.82 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.32 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  28.8 
 
 		 254 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.32 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.32 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5725  transcriptional regulator, MerR family  31.15 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.747282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.32 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  38.14 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.32 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>