40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0554 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  140  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  79.71 
 
 
69 aa  110  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  62.32 
 
 
76 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  59.42 
 
 
72 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  64 
 
 
64 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  59.65 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  47.06 
 
 
72 aa  72  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  51.52 
 
 
73 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  44.44 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  46.81 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  41.94 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  41.94 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1441  protein of unknown function UPF0150  39.71 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0633487  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  48.84 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  47.92 
 
 
57 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  52.27 
 
 
108 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  48.78 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  47.83 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0981  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
73 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  41.3 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  46.81 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  44.68 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  46.81 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  41.86 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2670  protein of unknown function UPF0150  36.36 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  38.3 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  38.3 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  42.55 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  45.24 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1463  hypothetical protein  34.29 
 
 
75 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  41.03 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  41.03 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  35.56 
 
 
68 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1511  hypothetical protein  34.29 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1504  hypothetical protein  34.29 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00554822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1470  hypothetical protein  34.29 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  34.09 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  34.09 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  46.34 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>