199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0475 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0475  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2676  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  44.27 
 
 
245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0612561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  38.67 
 
 
326 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3612  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  32.68 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.694677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3613  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  31.52 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  32 
 
 
290 aa  115  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  31.27 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  29.32 
 
 
272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  30.6 
 
 
272 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  31.6 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  28.95 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2506  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  32.8 
 
 
253 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000037877  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  28.37 
 
 
285 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  29.89 
 
 
273 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  29.75 
 
 
278 aa  105  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  31.17 
 
 
283 aa  105  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  29.81 
 
 
272 aa  102  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  31.98 
 
 
301 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5677  hypothetical protein  29.3 
 
 
261 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253035  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  30.53 
 
 
272 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  29.44 
 
 
281 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  29.8 
 
 
307 aa  99.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  27.56 
 
 
303 aa  99.4  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  29 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  27.64 
 
 
276 aa  97.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  31.6 
 
 
381 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  29.17 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  31.71 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  29.09 
 
 
299 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  29.04 
 
 
279 aa  96.3  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  32.02 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  28.11 
 
 
272 aa  94  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  27.38 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  26.55 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  28.3 
 
 
284 aa  92.8  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  27.73 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3354  hypothetical protein  28.86 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  28.36 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  28.79 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  26.8 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.89 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  27.6 
 
 
281 aa  89.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  28.42 
 
 
276 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  29.15 
 
 
285 aa  87  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.06 
 
 
276 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  27.64 
 
 
281 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  31.56 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  29.07 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  32.16 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  26.84 
 
 
270 aa  84  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  25.18 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  27.46 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.93 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  28.12 
 
 
558 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  31.87 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  29.15 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0128  phosphate binding protein  24.91 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  26.14 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  24.14 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.14 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.86 
 
 
302 aa  77  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  26.91 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  31.71 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.14 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  24.48 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  24.48 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  24.14 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.14 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.14 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  25.81 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  26.97 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1491  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  26.61 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000445289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.64 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.06 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  29.02 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.17 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  28.95 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  24.81 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  25.49 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  24.81 
 
 
558 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.71 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  28.9 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  25.21 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  22.93 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.74 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  23.92 
 
 
268 aa  72  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  29.31 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  25.79 
 
 
272 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  27.8 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  26.36 
 
 
519 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  28.72 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  28.41 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  25.4 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  26.82 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  25.46 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  31.06 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  27.62 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>