39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3548 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3548  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 292 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0747945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2546  transposase  54.61 
 
 		 277 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1122  transposase  54.61 
 
 		 277 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2530  transposase  54.61 
 
 		 277 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2996  transposase IS4 family protein  53.9 
 
 		 277 aa  281  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6762  transposase IS4 family protein  53.9 
 
 		 277 aa  280  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2771  transposase IS4 family protein  53.9 
 
 		 277 aa  280  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5748  transposase IS4 family protein  53.9 
 
 		 277 aa  279  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.970516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2963  transposase IS4 family protein  53.19 
 
 		 277 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0248  transposase  65.89 
 
 		 211 aa  267  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0696  transposase IS4 family protein  60.73 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2974  transposase IS4 family protein  49.64 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0960  hypothetical protein  48.61 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3531  transposase IS4 family protein  48.54 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2917  transposase IS4 family protein  48.54 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3449  transposase IS4 family protein  48.54 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4217  transposase, IS4  58.56 
 
 		 188 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.829185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  38.55 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  38.55 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  38.55 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  38.55 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  38.55 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.69 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  35 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  37.82 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  37.82 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  33.7 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  33.7 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  33.7 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  33.7 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  35.79 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  33.08 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  36.13 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0585  transposase IS4 family protein  36.75 
 
 		 253 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4215  hypothetical protein  55.45 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0963  hypothetical protein  36.82 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1056  hypothetical protein  44.78 
 
 		 126 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2371  transposase  27.83 
 
 		 122 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0905863  normal  0.352426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>