30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2005 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  100 
 
 		 124 aa  237  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  67.74 
 
 		 124 aa  143  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  59.68 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  58.06 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  56.45 
 
 		 123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  57.6 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  54.92 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  54.62 
 
 		 118 aa  117  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  52.42 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  54.4 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  52.1 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  59.68 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  46.77 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  54.64 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  46.43 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  47.15 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3523  hypothetical protein  45.24 
 
 		 128 aa  85.9  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  41.32 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  43.97 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0608  DoxX family protein  40.31 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  43.22 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  41.24 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  45.9 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  38.98 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4937  hypothetical protein  33.05 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  40.91 
 
 		 191 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  35.29 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4770  DoxX family protein  34.68 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00635642  hitchhiker  0.000154094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  35.29 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3625  hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>