More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1813 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
411 aa  794    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  52.56 
 
 
419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  60.89 
 
 
528 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  54.55 
 
 
766 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  55.93 
 
 
525 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  57.03 
 
 
468 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  52.12 
 
 
563 aa  276  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  54.78 
 
 
596 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  51.59 
 
 
418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  52.04 
 
 
659 aa  269  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  50.35 
 
 
487 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  55.89 
 
 
531 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  50.35 
 
 
675 aa  264  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  51.81 
 
 
422 aa  263  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  53.93 
 
 
562 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  56.7 
 
 
521 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  53.82 
 
 
470 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  51.55 
 
 
632 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  54.41 
 
 
776 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.38 
 
 
678 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  52.43 
 
 
525 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  52.27 
 
 
674 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  58.91 
 
 
659 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  48 
 
 
461 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  58.17 
 
 
621 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  60.82 
 
 
575 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  51.3 
 
 
501 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  55.04 
 
 
668 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  56.64 
 
 
377 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  57.41 
 
 
638 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
695 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  45.81 
 
 
493 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  52.01 
 
 
703 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  52.47 
 
 
559 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  51.03 
 
 
345 aa  235  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  47.81 
 
 
535 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  51.34 
 
 
583 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  51.69 
 
 
705 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  50.96 
 
 
674 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  51.32 
 
 
631 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  47.15 
 
 
509 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
564 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  51.22 
 
 
503 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  48.66 
 
 
468 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  51.89 
 
 
476 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  48.29 
 
 
571 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  48.34 
 
 
534 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  52.69 
 
 
460 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  49.04 
 
 
605 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.02 
 
 
512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
673 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  42.08 
 
 
595 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  49.06 
 
 
385 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  49.21 
 
 
553 aa  219  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  47.85 
 
 
581 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  47.64 
 
 
575 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.69 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  46.79 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  47.76 
 
 
493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  48.44 
 
 
855 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  49.82 
 
 
419 aa  213  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  55.5 
 
 
507 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
532 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  47.45 
 
 
466 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  48.71 
 
 
1029 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.47 
 
 
532 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
617 aa  209  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  48.89 
 
 
650 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  46.07 
 
 
405 aa  202  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  42.95 
 
 
543 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  47.17 
 
 
554 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  48.65 
 
 
556 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.44 
 
 
598 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  45.69 
 
 
501 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 
612 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3106  serine/threonine protein kinase  50.92 
 
 
538 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  43.33 
 
 
481 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.24 
 
 
614 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  44.71 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  45.15 
 
 
482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  38.57 
 
 
593 aa  183  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  46.46 
 
 
660 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  42.26 
 
 
543 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.47 
 
 
602 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.31 
 
 
591 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  38.94 
 
 
596 aa  180  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  42.52 
 
 
391 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  37.88 
 
 
612 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2937  protein kinase  42.37 
 
 
414 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0760127  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  40.86 
 
 
776 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.07 
 
 
584 aa  176  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2907  serine/threonine protein kinase  41.6 
 
 
414 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  41.58 
 
 
403 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2951  protein kinase  41.6 
 
 
414 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426406  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5484  serine/threonine protein kinase  41.58 
 
 
403 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403058  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5771  serine/threonine protein kinase  41.58 
 
 
405 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  41.78 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  36.75 
 
 
621 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40 
 
 
499 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  42.73 
 
 
673 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>