More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1584 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 140 aa  273  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  80.3 
 
 		 136 aa  218  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  78.03 
 
 		 134 aa  205  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  75.18 
 
 		 136 aa  203  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  74.24 
 
 		 137 aa  201  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  75 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  75 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  72.99 
 
 		 136 aa  198  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 136 aa  194  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  70.71 
 
 		 136 aa  188  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  70.68 
 
 		 138 aa  187  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  67.67 
 
 		 136 aa  187  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  66.42 
 
 		 135 aa  184  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1498  Nucleoside-diphosphate kinase  69.29 
 
 		 136 aa  184  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00169292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  67.94 
 
 		 136 aa  181  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2633  nucleoside diphosphate kinase  67.67 
 
 		 136 aa  177  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0272409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3552  nucleoside diphosphate kinase  65.93 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3557  nucleoside diphosphate kinase  65.93 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.252245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3625  nucleoside diphosphate kinase  65.93 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3490  Nucleoside-diphosphate kinase  63.64 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0976  Nucleoside-diphosphate kinase  60.84 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.954485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  64.39 
 
 		 141 aa  173  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3948  nucleoside diphosphate kinase  65.65 
 
 		 136 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  57.25 
 
 		 152 aa  170  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  58.14 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  58.14 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  58.14 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23840  nucleoside diphosphate kinase  61.54 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.882593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1461  Nucleoside-diphosphate kinase  62.5 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0805889  normal  0.284135 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  58.91 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1158  Nucleoside-diphosphate kinase  61.27 
 
 		 151 aa  163  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  58.14 
 
 		 139 aa  163  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  60.47 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3466  nucleoside diphosphate kinase  60.61 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  59.69 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  55.81 
 
 		 166 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  62.79 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2558  Nucleoside-diphosphate kinase  59.71 
 
 		 140 aa  160  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.927598  normal  0.152137 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  55.81 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 160 aa  158  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  56.59 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  55.81 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  56.59 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  59.2 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  54.26 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  56.59 
 
 		 139 aa  157  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  55.04 
 
 		 148 aa  156  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  55.04 
 
 		 148 aa  156  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0684  Nucleoside-diphosphate kinase  58.46 
 
 		 135 aa  156  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33705  normal  0.254357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  54.26 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09190  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.513672 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  55.04 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  55.81 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  56.59 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  50.38 
 
 		 138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3868  nucleoside diphosphate kinase  56.43 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211598  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0526  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  54.26 
 
 		 148 aa  153  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  54.26 
 
 		 148 aa  153  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  54.26 
 
 		 148 aa  153  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  54.26 
 
 		 148 aa  153  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  54.26 
 
 		 148 aa  153  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  54.26 
 
 		 148 aa  153  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  58.91 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0454  Nucleoside-diphosphate kinase  55.07 
 
 		 154 aa  153  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09920  nucleoside diphosphate kinase  55.71 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  53.49 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  51.16 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  55.04 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2149  Nucleoside-diphosphate kinase  57.97 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  54.26 
 
 		 149 aa  152  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  51.94 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2228  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0390683  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0381  nucleoside-diphosphate kinase  53.49 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02610  nucleoside-diphosphate kinase, putative  49.63 
 
 		 152 aa  150  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  54.26 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  54.26 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  51.94 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3489  nucleoside diphosphate kinase  54.29 
 
 		 141 aa  150  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  53.49 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0765  Nucleoside-diphosphate kinase  58.02 
 
 		 136 aa  150  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0463345  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  51.94 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  54.4 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  50.39 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  50.39 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  52.63 
 
 		 141 aa  146  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2524  Nucleoside-diphosphate kinase  52.67 
 
 		 154 aa  146  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2395  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 139 aa  146  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0825331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  52.71 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  53.49 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  53.49 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  54.26 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  51.94 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41676  nucleoside diphosphate kinase 1  48.84 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2227  nucleoside diphosphate kinase  51.52 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  53.6 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  48.84 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42104  nucleoside diphosphate kinase 2  51.91 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>