217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1281 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1281  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 271 aa  528  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2786  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  60 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4206  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  55.87 
 
 		 245 aa  238  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0660954 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07710  HAD-superfamily hydrolase (Eurofung)  37.02 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00258811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  36.22 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  33.85 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  32.2 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  30.3 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  32.31 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.72 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.21 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.77 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  27.73 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.77 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  24.46 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  30.46 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  31.44 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  31.44 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  31.44 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  30.46 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  31.68 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  30.66 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.16 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  27.92 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  31.44 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.47 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  31.22 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.37 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1907  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  32.32 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  27.6 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.05 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  31.82 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  29.29 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1926  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.89 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.661137  normal  0.820944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  30.64 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.2 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  27.95 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.31 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.94 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.77 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  28.33 
 
 		 228 aa  53.1  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  28.33 
 
 		 228 aa  53.1  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  29 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  31.96 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  31.96 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2463  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0330  HAD family hydrolase  29.31 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  29.79 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  31.96 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  31.96 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  31.96 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  31.96 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  31.96 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.68 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  44.44 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10440  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  31.96 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00307768  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.12 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  27.04 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  34.09 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.29 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.53 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  54.35 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  32.16 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  51.06 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3124  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  54.39 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  26.23 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 219 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3773  HAD family hydrolase  30.56 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2538  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  28.22 
 
 		 225 aa  49.3  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.94 
 
 		 232 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  24.4 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0732  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.71 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.595583  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  24.75 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06436  hypothetical protein  38.54 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3148  HAD family hydrolase  29.69 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0274068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.02 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.04 
 
 		 1053 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3210  HAD family hydrolase  29.69 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.742759  normal  0.278604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  30.92 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0853  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.58 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3160  HAD family hydrolase  29.69 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0720917  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.59 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  38.02 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1982  HAD family hydrolase  34.5 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2592  HAD family hydrolase  34.5 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.62 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1242  HAD family hydrolase  28.91 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1268  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>