211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2786 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2786  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 241 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4206  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  71.13 
 
 		 245 aa  331  8e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1281  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  60 
 
 		 271 aa  232  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07710  HAD-superfamily hydrolase (Eurofung)  36.75 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00258811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.78 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  32.26 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.65 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  32.26 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  31.85 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  32.26 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  32.26 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.26 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.26 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  32.26 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  29.26 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  30.84 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  29.26 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  29.26 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  30.84 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  31.56 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.11 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.87 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  36.76 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.02 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  29.78 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  27.92 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0330  HAD family hydrolase  32.2 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  31.28 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  35.5 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  35.5 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  35.5 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  35.5 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  35.5 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  29.53 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  35.5 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  36.36 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  28.93 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.34 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  35.96 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  36.23 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  28.78 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1268  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  39.1 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  33.82 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3773  HAD family hydrolase  29.05 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  43.48 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1853  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147437  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  36.75 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2616  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  27.86 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  27.94 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.53 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  40.43 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.29 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.81 
 
 		 235 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.79 
 
 		 217 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1982  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2592  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  23.31 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  38.75 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  27.85 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  38.96 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.36 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.87 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  36.59 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  24.89 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5923  HAD family hydrolase  33.17 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.14 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4073  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  40.4 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.358464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  36.59 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  30.32 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  35.29 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  32.71 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 218 aa  49.7  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10440  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  30.73 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00307768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.21 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  30.86 
 
 		 222 aa  48.9  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  37.74 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.02 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2538  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.74 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.09 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  36.05 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  35.04 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.48 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3124  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.94 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  32.5 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  35.05 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.02 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.33 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>