More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0958 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2972  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.76 
 
 
682 aa  669    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.18 
 
 
692 aa  652    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.06 
 
 
702 aa  811    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2007  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.95 
 
 
687 aa  731    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.877962  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
680 aa  1330    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2315  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.41 
 
 
680 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0546949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31020  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.36 
 
 
686 aa  733    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  64.3 
 
 
708 aa  804    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  65.38 
 
 
681 aa  840    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.56 
 
 
690 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.59 
 
 
686 aa  605  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.26 
 
 
694 aa  599  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.74 
 
 
690 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.54 
 
 
674 aa  581  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0159  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.67 
 
 
676 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.533108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.05 
 
 
692 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.87 
 
 
697 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.76 
 
 
692 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.97 
 
 
676 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.9 
 
 
695 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.68 
 
 
679 aa  572  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1410  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.22 
 
 
682 aa  571  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.27 
 
 
690 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.01 
 
 
696 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.82 
 
 
694 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4134  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.1 
 
 
688 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000385225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.26 
 
 
695 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.95 
 
 
698 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.85 
 
 
673 aa  561  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.11 
 
 
686 aa  561  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.96 
 
 
697 aa  558  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.99 
 
 
693 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.11 
 
 
693 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.2 
 
 
694 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.41 
 
 
698 aa  548  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.45 
 
 
700 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.05 
 
 
692 aa  548  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.63 
 
 
700 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.63 
 
 
700 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.97 
 
 
700 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.63 
 
 
700 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.32 
 
 
700 aa  548  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.63 
 
 
700 aa  548  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.63 
 
 
700 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.66 
 
 
700 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.02 
 
 
700 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.97 
 
 
700 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.63 
 
 
700 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.63 
 
 
700 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.63 
 
 
700 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2839  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.11 
 
 
700 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.58 
 
 
706 aa  542  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.43 
 
 
696 aa  545  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.11 
 
 
700 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.11 
 
 
700 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.64 
 
 
694 aa  542  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2022  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.9 
 
 
681 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0704  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.43 
 
 
688 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3371  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.17 
 
 
699 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029273  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.81 
 
 
689 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.64 
 
 
694 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.77 
 
 
695 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4141  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.92 
 
 
697 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.303073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0761  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.64 
 
 
696 aa  538  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417775  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.67 
 
 
692 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2153  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.64 
 
 
678 aa  535  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.68 
 
 
708 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.94 
 
 
699 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.95 
 
 
697 aa  535  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 
703 aa  532  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.12 
 
 
693 aa  535  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.68 
 
 
708 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.17 
 
 
695 aa  533  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.4 
 
 
693 aa  532  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.82 
 
 
699 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1748  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.47 
 
 
692 aa  529  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.35 
 
 
678 aa  529  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.51 
 
 
702 aa  531  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.35 
 
 
678 aa  528  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2029  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.63 
 
 
684 aa  526  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.79 
 
 
699 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.79 
 
 
699 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.58 
 
 
700 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1619  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.9 
 
 
700 aa  525  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.64 
 
 
699 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2695  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.92 
 
 
677 aa  522  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.27 
 
 
711 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.49 
 
 
699 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.63 
 
 
703 aa  521  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1753  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.67 
 
 
692 aa  520  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.98 
 
 
695 aa  522  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01850  flagellar biosynthesis protein A  45.67 
 
 
692 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.585433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.05 
 
 
699 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2616  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.67 
 
 
692 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000268529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1308  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.67 
 
 
692 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.201196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01839  hypothetical protein  45.67 
 
 
692 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.75 
 
 
699 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.43 
 
 
699 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.53 
 
 
703 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.76 
 
 
699 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>