30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2912 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2912  ferredoxin  100 
 
 		 224 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0453535 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2666  ferredoxin  31.43 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4094  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.88 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.56 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0849107  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0981  ferredoxin  29.33 
 
 		 273 aa  119  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000024477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4590  ferredoxin:4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.14 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1745  ferredoxin  30.99 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4302  ferredoxin  28.21 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0232293  decreased coverage  0.00591576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3934  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.32 
 
 		 220 aa  89  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2510  electron transport complex protein RnfC  40.91 
 
 		 790 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2803  ferredoxin  24.37 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1848  electron transport complex protein RnfC  40.91 
 
 		 793 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00264282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2066  electron transport complex protein RnfC  40.91 
 
 		 809 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00275367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1909  electron transport complex protein RnfC  40.91 
 
 		 799 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.567258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2170  electron transport complex protein RnfC  33.33 
 
 		 788 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0332538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0204  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  38.16 
 
 		 806 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00731411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2261  electron transport complex protein RnfC  37.88 
 
 		 884 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0443736  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  24.42 
 
 		 594 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2063  electron transport complex protein RnfC  37.88 
 
 		 885 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2110  electron transport complex protein RnfC  37.88 
 
 		 888 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4547  electron transport complex protein RnfC  37.88 
 
 		 884 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2275  electron transport complex protein RnfC  37.88 
 
 		 876 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169634  normal  0.804532 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2174  electron transport complex protein RnfC  38.98 
 
 		 846 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1451  ferredoxin  24.37 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.340001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  25.12 
 
 		 493 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0393  hypothetical protein  27.04 
 
 		 437 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.544976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  36.73 
 
 		 321 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2355  electron transport complex protein RnfC  37.88 
 
 		 825 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1543  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.31 
 
 		 981 aa  41.6  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0434  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  39.62 
 
 		 806 aa  41.6  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>