More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2962 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2962  Carbonate dehydratase  100 
 
 
201 aa  418  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2001  carbonate dehydratase  73.2 
 
 
199 aa  311  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3517  carbonic anhydrase  73.06 
 
 
211 aa  309  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038401  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  72.68 
 
 
215 aa  308  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3955  Carbonate dehydratase  75.77 
 
 
195 aa  300  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000782852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3868  carbonic anhydrase  75.25 
 
 
200 aa  299  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2841  carbonate dehydratase  69.39 
 
 
196 aa  290  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.102659 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0986  carbonate dehydratase  50.79 
 
 
193 aa  207  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0207878  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  50.53 
 
 
194 aa  205  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.24835 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  50 
 
 
193 aa  198  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0316  carbonate dehydratase  45.21 
 
 
193 aa  181  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  43.46 
 
 
220 aa  159  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1824  carbonate dehydratase  42.64 
 
 
204 aa  155  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000671505  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  41.4 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  36.76 
 
 
231 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  37.11 
 
 
223 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0788  carbonic anhydrase  38.34 
 
 
219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969871  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3665  carbonate dehydratase  37.11 
 
 
217 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.148403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  37.5 
 
 
234 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  36.63 
 
 
227 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  37.44 
 
 
207 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1874  carbonate dehydratase  39.11 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  39.49 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  33.67 
 
 
236 aa  135  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  40 
 
 
237 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  37.88 
 
 
213 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05611  carbonic anhydrase Nce103, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11250)  40.31 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0148146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1417  carbonate dehydratase  36.19 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  36.98 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5677  carbonate dehydratase  38.34 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  36.73 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  36.41 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  37.17 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  36.13 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1508  Carbonate dehydratase  39.79 
 
 
208 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689145  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  39.7 
 
 
230 aa  132  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  33.67 
 
 
242 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  37.7 
 
 
213 aa  132  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  37.7 
 
 
213 aa  132  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1052  carbonic anhydrase  35.57 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00282225  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1335  Carbonate dehydratase  38.14 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144565  normal  0.0709099 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  35.12 
 
 
230 aa  131  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  36.22 
 
 
278 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0403  putative carbonic anhydrase  35.57 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.731592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0746  carbonic anhydrase  35.57 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1120  carbonic anhydrase  35.57 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.522446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1288  putative carbonic anhydrase  35.57 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  38.07 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1281  putative carbonic anhydrase  35.57 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  35.38 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  37.56 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1442  carbonic anhydrase  37.57 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323466  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1839  carbonic anhydrase  36.51 
 
 
224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.885285  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  39.8 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1426  carbonic anhydrase  36.51 
 
 
224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  37.88 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  39.8 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  33.51 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  37.11 
 
 
219 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  34.54 
 
 
248 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  37.97 
 
 
212 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2700  carbonate dehydratase  36.92 
 
 
229 aa  129  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1403  Carbonate dehydratase  38.22 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  37.11 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  33.33 
 
 
356 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0739  carbonic anhydrase  36.79 
 
 
211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  35.05 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  32.99 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  38.02 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3223  putative carbonic anhydrase protein  37.37 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  36.65 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  35.08 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  35.57 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  34.02 
 
 
243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  36.13 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  33.68 
 
 
242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  33.67 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  37.04 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  36.51 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  35.05 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0412  Carbonate dehydratase  37 
 
 
220 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  36.6 
 
 
234 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0840  carbonic anhydrase  36.17 
 
 
230 aa  126  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0252218  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  36.51 
 
 
201 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  0.000000000969176 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0190  carbonic anhydrase  36.13 
 
 
220 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.483566 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  35 
 
 
210 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0195  carbonic anhydrase  36.13 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0203  carbonic anhydrase  36.13 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  36.79 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  36.92 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0186  carbonic anhydrase  36.13 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316931  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0187  carbonic anhydrase  36.13 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13235  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  36.92 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  34.34 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  36.92 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  36.92 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0119  carbonic anhydrase  36.13 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  36.13 
 
 
220 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  36.13 
 
 
220 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>