43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1496 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1496  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.768836  normal  0.638636 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  33.55 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  34.16 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  33.96 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  32.3 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 354 aa  65.5  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  31.87 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  29.68 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  33.54 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  32.05 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  32.35 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  32.93 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  34.19 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  30.17 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  30.43 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  32.48 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  31.29 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  33.52 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  32.04 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  31.29 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  32.04 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  33.12 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  31.45 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  28.57 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  32.05 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  30.97 
 
 		 187 aa  52.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  30.13 
 
 		 191 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  30.19 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  28.99 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  28.73 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  31.55 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  27.5 
 
 		 183 aa  48.9  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  28.65 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  31.78 
 
 		 167 aa  48.9  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  28.78 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3054  beta-Ig-H3/fasciclin  30.13 
 
 		 179 aa  45.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 164 aa  45.4  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  29.81 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  31.71 
 
 		 337 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  26.72 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  28.81 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  29.87 
 
 		 279 aa  42.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>