More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1352 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  100 
 
 
463 aa  904    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  72.62 
 
 
453 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  74.47 
 
 
460 aa  596  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  74.7 
 
 
450 aa  594  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  71.65 
 
 
464 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  70.82 
 
 
444 aa  570  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  69.7 
 
 
444 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  69.48 
 
 
451 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  70.21 
 
 
444 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  66.04 
 
 
463 aa  548  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  69.16 
 
 
443 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  71.23 
 
 
441 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  70.49 
 
 
444 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  58.37 
 
 
450 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  60.76 
 
 
448 aa  501  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  66.2 
 
 
458 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  66.67 
 
 
452 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  58.22 
 
 
429 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  57.78 
 
 
426 aa  489  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  58.64 
 
 
456 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  56.38 
 
 
456 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  58.41 
 
 
456 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  59.81 
 
 
446 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  58.31 
 
 
462 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  59.35 
 
 
446 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  59.4 
 
 
447 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  58.95 
 
 
450 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53800  manganese transport protein MntH  66.21 
 
 
438 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0707822  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  61.12 
 
 
448 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  54.57 
 
 
622 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  58.23 
 
 
460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  54.85 
 
 
448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  55.22 
 
 
435 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  51.4 
 
 
442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  53.69 
 
 
463 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3226  Mn2+/Fe2+ transporter  48.96 
 
 
473 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  53.18 
 
 
627 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  48.6 
 
 
438 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  51.06 
 
 
442 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  50.35 
 
 
442 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  50.12 
 
 
454 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  53.01 
 
 
625 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  48.93 
 
 
438 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  48.93 
 
 
438 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  48.93 
 
 
438 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  46.59 
 
 
453 aa  388  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  48.93 
 
 
438 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  50.95 
 
 
445 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  45.31 
 
 
450 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  45.31 
 
 
450 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  52.43 
 
 
418 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  48.15 
 
 
437 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  48.15 
 
 
437 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  48.15 
 
 
437 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  48.15 
 
 
437 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  48.15 
 
 
437 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.56 
 
 
448 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  51.5 
 
 
442 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  50.12 
 
 
439 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0339  manganese transporter NRAMP  45.03 
 
 
464 aa  374  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00143426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1280  Mn2+/Fe2+ transporter  50.61 
 
 
448 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.547959 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  45.18 
 
 
444 aa  369  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1949  Mn2+/Fe2+ transporter  51.97 
 
 
448 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344744  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  49.17 
 
 
438 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0246  manganese transport protein MntH  44.8 
 
 
444 aa  368  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2499  manganese transport protein MntH  51.24 
 
 
410 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.645994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  52 
 
 
441 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  47.39 
 
 
452 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  49.87 
 
 
391 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2310  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  51.97 
 
 
433 aa  359  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2180  manganese/iron transporter  51.86 
 
 
435 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2124  manganese/iron transporter  51.86 
 
 
435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2311  manganese transport protein  51.86 
 
 
435 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1789  Mn2+/Fe2+ transporter  51.86 
 
 
435 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0106  Mn2+/Fe2+ transporter  51.86 
 
 
435 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D30  manganese transporter NRAMP  42.92 
 
 
525 aa  345  7e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000755311  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  44.62 
 
 
446 aa  344  2e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2275  manganese/iron transporter  51.6 
 
 
520 aa  342  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626373  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1555  Mn2+/Fe2+ transporter  41.07 
 
 
434 aa  334  2e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000268932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1861  Mn2+/Fe2+ transporter  43.34 
 
 
530 aa  332  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0311  Mn2+/Fe2+ transporter  43.35 
 
 
449 aa  329  5.0000000000000004e-89  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2025  Mn2+/Fe2+ transporter  40.97 
 
 
522 aa  323  3e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1795  manganese transporter NRAMP  42.99 
 
 
532 aa  322  6e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1183  manganese transporter NRAMP  44.21 
 
 
473 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  45.73 
 
 
434 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  43.57 
 
 
442 aa  312  7.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  44.85 
 
 
435 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  43.14 
 
 
409 aa  309  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  43.14 
 
 
409 aa  309  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  44.85 
 
 
436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  44.85 
 
 
436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  45.36 
 
 
439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  44.85 
 
 
436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  42.44 
 
 
438 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  42.48 
 
 
412 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  42.48 
 
 
412 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  42.48 
 
 
412 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.48 
 
 
412 aa  306  7e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  42.48 
 
 
412 aa  306  7e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  42.48 
 
 
412 aa  306  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>