50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4759 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  62.31 
 
 		 202 aa  248  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  64.4 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  53.03 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  40.53 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  36.22 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  35.71 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  33.17 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  34.09 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  36.36 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  38.12 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  27.86 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  35.6 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  36.24 
 
 		 234 aa  92.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  29.13 
 
 		 239 aa  91.7  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  34.55 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  34.25 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  31.75 
 
 		 220 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  32.35 
 
 		 301 aa  89  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  31.37 
 
 		 273 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  31.37 
 
 		 273 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  31.37 
 
 		 273 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  34.41 
 
 		 256 aa  87.8  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  33.88 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  29.9 
 
 		 532 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  31.37 
 
 		 304 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  28.36 
 
 		 243 aa  84.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  30.85 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  32 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  32.04 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  33.15 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  30 
 
 		 449 aa  82.4  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  32.68 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  27.94 
 
 		 327 aa  78.2  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  28.43 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  29.74 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  30.89 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  26.37 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  28.5 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  30.99 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  26.6 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  30.28 
 
 		 247 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  30.28 
 
 		 247 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  25.55 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  27.04 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  27.04 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  24.48 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  24.48 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04170  hypothetical protein  36.49 
 
 		 82 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>