More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2635 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  100 
 
 
199 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  50.25 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0767  Methyltransferase type 11  45.3 
 
 
194 aa  140  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13866  hypothetical protein  35.03 
 
 
191 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  44.2 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  43.52 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2318  methyltransferase type 11  32.22 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0735638 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  43.52 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  42.59 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  36.72 
 
 
320 aa  75.1  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  38.24 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.17 
 
 
325 aa  71.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
331 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  39.42 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
332 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  34.29 
 
 
327 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
341 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2786  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0321323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.9 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.17 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  38.4 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.74 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.67 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 
310 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  40.57 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1004  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.8 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.202483  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1066  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.8 
 
 
269 aa  64.7  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.67 
 
 
251 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.55 
 
 
251 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  38.18 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  35.77 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.45 
 
 
251 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.33 
 
 
261 aa  63.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 
260 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.83 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
259 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.26 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  35.45 
 
 
246 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  38.19 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE, putative  32.62 
 
 
256 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
217 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.73 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1317  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.8 
 
 
263 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
251 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.96 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
251 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28.67 
 
 
271 aa  62.8  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  34.96 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.96 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
251 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
251 aa  62.4  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4394  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.96 
 
 
221 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.55 
 
 
251 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.96 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
251 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
251 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
251 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  42.34 
 
 
260 aa  62  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.61 
 
 
260 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0734  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
264 aa  61.6  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599547  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
251 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.03 
 
 
239 aa  62  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.67 
 
 
266 aa  62  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
251 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
251 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
251 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
251 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
251 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  33.64 
 
 
251 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  31.82 
 
 
259 aa  61.6  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
252 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
208 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  35.83 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0537  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.11 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 
244 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.73 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.55 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  41.35 
 
 
457 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.62 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>