More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0767 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0767  Methyltransferase type 11  100 
 
 
194 aa  387  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  44.1 
 
 
196 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  44.91 
 
 
199 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  46.72 
 
 
228 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.23 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  35.56 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  39.1 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13866  hypothetical protein  32.49 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4394  Methyltransferase type 11  30.27 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  42.2 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  43.12 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  35.26 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  31.4 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  33.09 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2786  Methyltransferase type 11  34.22 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0321323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  37.14 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  40 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  31.4 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.58 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  37.21 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  28.17 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.75 
 
 
238 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1867  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000037556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
281 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.75 
 
 
236 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  28.93 
 
 
235 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
328 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  34.13 
 
 
233 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  35.71 
 
 
327 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
328 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  30 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
331 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
328 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.26 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
324 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  43.64 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
204 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2318  methyltransferase type 11  32.57 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0735638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.33 
 
 
251 aa  62  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 
320 aa  62  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.33 
 
 
280 aa  61.6  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
332 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
341 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.33 
 
 
251 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.33 
 
 
251 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.33 
 
 
251 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.33 
 
 
251 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
271 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  28.32 
 
 
398 aa  61.6  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.33 
 
 
251 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41 
 
 
241 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
310 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  38.02 
 
 
295 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0734  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599547  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.54 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.3 
 
 
325 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0899  methyltransferase  34.62 
 
 
328 aa  58.9  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.52 
 
 
229 aa  58.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.07 
 
 
213 aa  58.5  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  35.24 
 
 
263 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
225 aa  58.9  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 
251 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 
251 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  33.1 
 
 
168 aa  58.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  31.4 
 
 
268 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 
251 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 
251 aa  58.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 
251 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 
251 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 
251 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  40 
 
 
217 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  35.29 
 
 
221 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  38.71 
 
 
221 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.29 
 
 
221 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.29 
 
 
221 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.29 
 
 
221 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.29 
 
 
221 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0537  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.29 
 
 
221 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.79 
 
 
238 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.97 
 
 
261 aa  58.2  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.41 
 
 
293 aa  57.8  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
256 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
256 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4299  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
266 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  35.19 
 
 
243 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>