284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2852 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2852  diacylglycerol kinase catalytic region  100 
 
 
321 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.156551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1361  diacylglycerol kinase catalytic region  90.6 
 
 
321 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.758230000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2544  diacylglycerol kinase, catalytic region  52.67 
 
 
323 aa  271  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.502154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2183  hypothetical protein  52.44 
 
 
318 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.681145  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4745  diacylglycerol kinase catalytic region  51.16 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2359  diacylglycerol kinase  45.7 
 
 
343 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1722  hypothetical protein  42.48 
 
 
332 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0741572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2867  diacylglycerol kinase catalytic region  42.24 
 
 
343 aa  179  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3825  diacylglycerol kinase catalytic region  46.39 
 
 
335 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61177  normal  0.232851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3490  diacylglycerol kinase, catalytic region  42.15 
 
 
372 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0958  diacylglycerol kinase, catalytic region  39.16 
 
 
306 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.035729 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0338  hypothetical protein  38.89 
 
 
305 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1982  diacylglycerol kinase, catalytic region  38.56 
 
 
305 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65141  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2381  diacylglycerol kinase, catalytic region  33.22 
 
 
326 aa  112  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3102  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.8 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4424  diacylglycerol kinase catalytic region  32.33 
 
 
299 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0721369  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4888  diacylglycerol kinase catalytic region  31.67 
 
 
299 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3900  diacylglycerol kinase catalytic region  29.2 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377313  normal  0.188998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  25.09 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3189  diacylglycerol kinase catalytic region  29.59 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1920  hypothetical protein  23.61 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  31.21 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  26.79 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1401  hypothetical protein  28.85 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  28.96 
 
 
326 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  28.57 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  38.89 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  25.41 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3289  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.2 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.169628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3215  Sphingosine kinase-like protein  31.91 
 
 
506 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1968  diacylglycerol kinase catalytic region  31.87 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  30.23 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  40.74 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  28.46 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1994  diacylglycerol kinase catalytic region  32.58 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0635024  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4934  diacylglycerol kinase catalytic region  31.44 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  0.157048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  27.82 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0950  diacylglycerol kinase catalytic region  28.47 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  26.79 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  38.18 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0418  diacylglycerol kinase catalytic region  23.17 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0654  diacylglycerol kinase catalytic region  27.78 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1099  diacylglycerol kinase catalytic region  33.33 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  35.92 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  36.07 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  26.1 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  26.1 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  25.1 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  27.94 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  28.41 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6348  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.43 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  31.52 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  30.63 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  24.6 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3156  diacylglycerol kinase catalytic region  31.37 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324114  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  29.88 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  27.03 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1885  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.87 
 
 
471 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000885175  normal  0.0968816 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1933  hypothetical protein  22.99 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  38.28 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  27.92 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3383  diacylglycerol kinase catalytic region  28.01 
 
 
403 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3489  diacylglycerol kinase catalytic region  30.98 
 
 
541 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139861  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  29.1 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1249  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.28 
 
 
489 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.195733  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  39.6 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2853  hypothetical protein  32.68 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1590  diacylglycerol kinase catalytic region  27.71 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.49251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  29.17 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  29.01 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  30.94 
 
 
364 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  26.37 
 
 
297 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  25.65 
 
 
312 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0800  hypothetical protein  28.86 
 
 
292 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3059  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.19 
 
 
533 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1500  diacylglycerol kinase catalytic region  25.34 
 
 
433 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  33.17 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  29.06 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  29.06 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2406  diacylglycerol kinase catalytic region  26.36 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.45203  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  41.86 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  31.2 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  40.82 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  28.63 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  29.06 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  34.07 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  28.25 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0619  hypothetical protein  28.26 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  29.06 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  34.07 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  28.63 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  28.63 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  28.63 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  28.63 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7710  diacylglycerol kinase catalytic region  42.7 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  39.8 
 
 
319 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  28.63 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1675  putative lipid kinase  26.44 
 
 
345 aa  59.7  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22000  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  29.6 
 
 
480 aa  59.3  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00559373  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  24.76 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>