More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0562 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3299  carboxyl transferase domain-containing protein  85.07 
 
 		 536 aa  959    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.96484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3262  Propionyl-CoA carboxylase  86.76 
 
 		 574 aa  1035    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4093  propionyl-CoA carboxylase  82.4 
 
 		 574 aa  993    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0651  propionyl-CoA carboxylase  92.33 
 
 		 574 aa  1091    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3248  carboxyl transferase  83.28 
 
 		 574 aa  1004    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000151577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0496  Propionyl-CoA carboxylase  82.58 
 
 		 574 aa  999    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0463  propionyl-CoA carboxylase  82.93 
 
 		 574 aa  1004    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0491  Propionyl-CoA carboxylase  82.23 
 
 		 574 aa  998    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.669185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0575  Propionyl-CoA carboxylase  98.78 
 
 		 574 aa  1176    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3488  propionyl-CoA carboxylase  89.55 
 
 		 574 aa  1073    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0562  carboxyl transferase  100 
 
 		 574 aa  1184    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0437  carboxyl transferase  33.71 
 
 		 509 aa  297  4e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.137321  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  36.31 
 
 		 513 aa  296  8e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  34.69 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  38.55 
 
 		 508 aa  294  3e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  35.15 
 
 		 516 aa  292  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  35.88 
 
 		 513 aa  292  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  36.12 
 
 		 521 aa  291  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  35.73 
 
 		 510 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  34.04 
 
 		 524 aa  289  8e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  36.7 
 
 		 513 aa  289  8e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  35.45 
 
 		 517 aa  289  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  35.89 
 
 		 514 aa  287  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  35.43 
 
 		 515 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  34.28 
 
 		 523 aa  287  5e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  35.56 
 
 		 515 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  35.14 
 
 		 510 aa  286  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  36.12 
 
 		 514 aa  286  8e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  36.83 
 
 		 513 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  38.99 
 
 		 516 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  34.85 
 
 		 514 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  34.65 
 
 		 520 aa  284  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  37.89 
 
 		 516 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  35.36 
 
 		 510 aa  282  9e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  34.76 
 
 		 510 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  38.05 
 
 		 527 aa  281  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  34.37 
 
 		 510 aa  280  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  36.17 
 
 		 510 aa  280  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  34.17 
 
 		 510 aa  280  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  33.98 
 
 		 510 aa  280  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0796  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  33.33 
 
 		 518 aa  279  8e-74  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  34.3 
 
 		 531 aa  279  9e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  38.71 
 
 		 508 aa  279  1e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  34.78 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  34.56 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  34.72 
 
 		 514 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  33.59 
 
 		 518 aa  277  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  35.95 
 
 		 519 aa  277  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  33.79 
 
 		 522 aa  277  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  37.92 
 
 		 514 aa  276  7e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  34.98 
 
 		 508 aa  276  8e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  36.61 
 
 		 516 aa  276  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  33.79 
 
 		 510 aa  276  9e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  34.58 
 
 		 527 aa  276  9e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  35.77 
 
 		 510 aa  276  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  34.27 
 
 		 514 aa  276  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  36.6 
 
 		 516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  33.97 
 
 		 516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  33.79 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  34.17 
 
 		 510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  33.46 
 
 		 510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  33.71 
 
 		 517 aa  274  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  32.76 
 
 		 510 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  37.58 
 
 		 522 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  35.84 
 
 		 564 aa  274  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  32.87 
 
 		 510 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  33.92 
 
 		 510 aa  273  6e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  34.58 
 
 		 510 aa  273  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  33.98 
 
 		 510 aa  273  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  34.47 
 
 		 529 aa  273  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  33.9 
 
 		 518 aa  273  7e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  34.58 
 
 		 510 aa  273  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2771  carboxyl transferase  32.46 
 
 		 549 aa  273  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  34.58 
 
 		 510 aa  273  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  34.66 
 
 		 513 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  34.78 
 
 		 510 aa  273  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  34.58 
 
 		 510 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  34.27 
 
 		 513 aa  272  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  36.28 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  35.38 
 
 		 510 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  34.97 
 
 		 518 aa  272  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  35.38 
 
 		 510 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  33.86 
 
 		 527 aa  272  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  33.6 
 
 		 519 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  33 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  35.25 
 
 		 519 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1317  carboxyl transferase  35.59 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  35.25 
 
 		 530 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  36.45 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  35 
 
 		 510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45886  predicted protein  38.24 
 
 		 581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  33.4 
 
 		 510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  33.4 
 
 		 512 aa  271  2.9999999999999997e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  34.35 
 
 		 512 aa  270  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  36.67 
 
 		 528 aa  270  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1099  propionyl-CoA carboxylase  34.31 
 
 		 535 aa  270  5.9999999999999995e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  35.57 
 
 		 510 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0599  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  33.15 
 
 		 510 aa  270  7e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  33.79 
 
 		 510 aa  269  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  33.59 
 
 		 510 aa  270  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>