More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0999 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0999  late competence protein ComER  100 
 
 
272 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2452  late competence protein ComER  72.69 
 
 
273 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00347201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4179  late competence protein ComER  57.72 
 
 
275 aa  338  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4448  late competence protein ComER  58.09 
 
 
275 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0500501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0789  late competence protein ComER  58.09 
 
 
275 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0125118  hitchhiker  0.000000168646 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4409  late competence protein ComER  57.72 
 
 
275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4225  late competence protein ComER  57.72 
 
 
275 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.755037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4350  late competence protein ComER  57.72 
 
 
275 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4461  late competence protein ComER  57.35 
 
 
275 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000265732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3054  late competence protein ComER  55.51 
 
 
283 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4073  late competence protein ComER  56.49 
 
 
265 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4063  late competence protein ComER  56.49 
 
 
265 aa  315  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00294057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4554  late competence protein ComER  56.49 
 
 
265 aa  315  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00155928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0740  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.34 
 
 
266 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1294  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.68 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0466034  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1560  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.61 
 
 
271 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1591  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.61 
 
 
271 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.542634  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0937  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.13 
 
 
268 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1065  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.86 
 
 
271 aa  94  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.378355  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.6 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  28.86 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.02 
 
 
270 aa  88.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1990  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.54 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.307416  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.9 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.53 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.31 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.95 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23950  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.86 
 
 
275 aa  85.9  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264409  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.34 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.62 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.79 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.19 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.75 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.62 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.06 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.28 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.1 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.5 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.5 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.5 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2581  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.3 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.51 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.62 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.7 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.63 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.21 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.83 
 
 
279 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.33 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.29 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.02 
 
 
265 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.69 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.73 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.83 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.62 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2285  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.2 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.39 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.69 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.29 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.46 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.29 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.29 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.29 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.29 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3348  pyrroline-5-carboxylate reductase  28 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.42 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.34 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.17 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.82 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5956  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.17 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.377479  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.27 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.22 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.29 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0893  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.9 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.24 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.63 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.54 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.97 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.97 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5524  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.7 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122129  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0182  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.94 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.72 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.47 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.44 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3161  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.42 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00631355 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.16 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.86 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.27 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.61 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.35 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.47 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.07 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.07 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  24.07 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.65 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.07 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.07 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.65 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.07 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.07 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.83 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>