More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0164 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2407  DEAD/DEAH box helicase domain protein  80.5 
 
 
435 aa  735    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.74616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
436 aa  895    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3013  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.99 
 
 
436 aa  557  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4366  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  62.61 
 
 
436 aa  549  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000110703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4187  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  62.39 
 
 
436 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4025  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  62.39 
 
 
436 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4035  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  62.39 
 
 
436 aa  548  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000492575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4403  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  62.39 
 
 
436 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000107871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  62.39 
 
 
436 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000163692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4307  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  62.39 
 
 
436 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.163670000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4419  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  62.61 
 
 
436 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000144636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0833  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  62.16 
 
 
436 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  hitchhiker  0.0000000000789178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.49 
 
 
436 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000176231  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0462  superfamily II DNA/RNA helicase  48.85 
 
 
446 aa  432  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1616  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.97 
 
 
448 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.309346  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.97 
 
 
448 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0163968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  47.58 
 
 
448 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000682714  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0532  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.55 
 
 
457 aa  414  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000013881  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1664  superfamily II DNA/RNA helicase  51.3 
 
 
447 aa  409  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0289  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50 
 
 
447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1584  superfamily II DNA/RNA helicase  46.53 
 
 
454 aa  392  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1285  superfamily II DNA/RNA helicase  45.6 
 
 
454 aa  365  1e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl273  ATP-dependent RNA helicase  40.46 
 
 
460 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00339655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0420  superfamily II DNA/RNA helicase  41.48 
 
 
464 aa  317  3e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0500  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.04 
 
 
453 aa  300  4e-80  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0107165  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0686  ATP-dependent RNA helicase  35.61 
 
 
445 aa  281  1e-74  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2301  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.21 
 
 
450 aa  279  8e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2475  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.21 
 
 
450 aa  279  8e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2269  ATP-dependent RNA helicase  40.92 
 
 
450 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2223  ATP-dependent RNA helicase  40.92 
 
 
450 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2496  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  40.92 
 
 
450 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2900  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  40.63 
 
 
450 aa  276  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426255  normal  0.0366346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.5 
 
 
532 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2571  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  41.21 
 
 
454 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.63 
 
 
450 aa  275  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000706088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.01 
 
 
539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.35 
 
 
447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000655646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2430  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  40.35 
 
 
458 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  37.78 
 
 
527 aa  268  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.96 
 
 
581 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0434047 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.78 
 
 
498 aa  266  4e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1643  superfamily II DNA/RNA helicase  38.06 
 
 
521 aa  266  4e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605464  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  35.63 
 
 
528 aa  265  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.02 
 
 
528 aa  265  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.34 
 
 
460 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4475  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.44 
 
 
457 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.06 
 
 
405 aa  263  6e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  39.09 
 
 
656 aa  260  3e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.13 
 
 
584 aa  261  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3324  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.77 
 
 
446 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.67 
 
 
511 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.67 
 
 
525 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.67 
 
 
528 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  36.67 
 
 
528 aa  259  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  36.67 
 
 
528 aa  259  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.67 
 
 
528 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.67 
 
 
525 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.67 
 
 
528 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  40.71 
 
 
513 aa  259  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  36.67 
 
 
533 aa  259  8e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  36.67 
 
 
529 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0442  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.41 
 
 
513 aa  258  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4277  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.46 
 
 
485 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.94 
 
 
466 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.94 
 
 
467 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4337  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.46 
 
 
485 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0666  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.06 
 
 
625 aa  257  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477317  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.11 
 
 
538 aa  257  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3732  DEAD/DEAH box helicase-like  39.26 
 
 
495 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  39.07 
 
 
572 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.18 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.93 
 
 
527 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.29 
 
 
527 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.64 
 
 
565 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.21 
 
 
590 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39 
 
 
532 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.55 
 
 
434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5247  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.36 
 
 
481 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  36.11 
 
 
485 aa  252  8.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  36.91 
 
 
551 aa  250  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.22 
 
 
541 aa  249  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5577  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.64 
 
 
481 aa  249  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.652435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.39 
 
 
533 aa  249  8e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.54 
 
 
643 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.41 
 
 
530 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5370  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.46 
 
 
481 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200249  hitchhiker  0.000118205 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5307  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.59 
 
 
481 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5703  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.59 
 
 
481 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.44 
 
 
531 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  38.48 
 
 
530 aa  247  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5548  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.59 
 
 
481 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000095828 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.14 
 
 
583 aa  246  4e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5149  ATP-dependent RNA helicase  34.59 
 
 
481 aa  247  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2267  hypothetical protein  36.11 
 
 
589 aa  247  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.59 
 
 
529 aa  247  4e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2294  hypothetical protein  36.11 
 
 
589 aa  246  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5135  ATP-dependent RNA helicase  36.46 
 
 
481 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.557571  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  37.98 
 
 
590 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.66 
 
 
584 aa  245  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0042  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.36 
 
 
420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>