41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2576 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2576  stage VI sporulation protein D  100 
 
 		 431 aa  850    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0876  stage VI sporulation protein D  73.03 
 
 		 351 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4551  stage VI sporulation protein D, putative  50 
 
 		 325 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4193  stage VI sporulation protein D  50 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4204  stage VI sporulation protein D  49.63 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4357  stage VI sporulation protein D  49.63 
 
 		 327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4692  stage VI sporulation protein D  49.63 
 
 		 327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4547  putative stage VI sporulation protein D  49.63 
 
 		 327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4596  putative stage VI sporulation protein D  49.63 
 
 		 327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3176  sporulation stage VI protein D  51.47 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4578  putative stage VI sporulation protein D  48.89 
 
 		 326 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0656  putative stage VI sporulation protein D  49.25 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4305  sporulation stage VI protein D  48.51 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  41.51 
 
 		 128 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  40.43 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  41.86 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  52.38 
 
 		 590 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.73 
 
 		 75 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44 
 
 		 470 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.43 
 
 		 515 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  44.68 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.11 
 
 		 534 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.64 
 
 		 289 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  47.92 
 
 		 255 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  45.65 
 
 		 751 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4365  Peptidoglycan-binding LysM  41.86 
 
 		 229 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  37.7 
 
 		 539 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 191 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  36.96 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  51.28 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 		 192 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  34.43 
 
 		 509 aa  44.3  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  41.51 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 		 754 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2402  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 511 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  36.36 
 
 		 546 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.21 
 
 		 797 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  52.17 
 
 		 522 aa  43.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 430 aa  43.1  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  34 
 
 		 520 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>