35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2002 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2002  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 
71 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  67.14 
 
 
87 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  52.17 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  50.72 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  44.93 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.69 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  46.03 
 
 
87 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  42.03 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.62 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.03 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.48 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.03 
 
 
87 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  51.02 
 
 
87 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  30.99 
 
 
88 aa  53.9  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  38.24 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.62 
 
 
92 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.88 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  32.35 
 
 
87 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  39.68 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  36.36 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  35.71 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  32.26 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2839  CRISPR-associated protein Cas2  33.8 
 
 
87 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.230646  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.21 
 
 
87 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  42.86 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.14 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.84 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.62 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  35.29 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  35.21 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.51 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.48 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  32.84 
 
 
87 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.84 
 
 
87 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.16 
 
 
87 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>