More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1782 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0697  amino acid permease family protein  73.64 
 
 
465 aa  694    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0684  amino acid permease family protein  74.51 
 
 
465 aa  699    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0596  amino acid permease family protein  74.51 
 
 
465 aa  699    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0540  arginine/ornithine antiporter protein  74.29 
 
 
465 aa  699    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0540  arginine/ornithine antiporter protein  74.07 
 
 
465 aa  697    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00650316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1782  amino acid permease-associated region  100 
 
 
473 aa  940    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0629  amino acid permease family protein  74.29 
 
 
465 aa  697    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0758  amino acid permease family protein  74.29 
 
 
465 aa  699    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4672  amino acid permease family protein  74.07 
 
 
465 aa  695    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.1139e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0542  amino acid permease-associated region  73.86 
 
 
465 aa  694    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0537  amino acid permease-associated region  71.91 
 
 
474 aa  647    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0665  amino acid permease family protein  74.07 
 
 
465 aa  697    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0754  arginine/ornithine antiporter  58.24 
 
 
474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0683  amino acid permease-associated region  58.39 
 
 
471 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0941  amino acid permease family protein  57.91 
 
 
474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000289126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0937  amino acid permease family protein  57.69 
 
 
474 aa  560  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4436  amino acid permease family protein  57.48 
 
 
474 aa  559  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0280359  normal  0.0537632 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1029  amino acid permease family protein  57.6 
 
 
474 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.530326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0901  amino acid permease family protein  58.23 
 
 
474 aa  558  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.264525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0749  arginine/ornithine antiporter  57.23 
 
 
474 aa  557  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000982146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0755  amino acid permease-associated region  58.26 
 
 
474 aa  556  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.254398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0805  amino acid permease family protein  56.64 
 
 
456 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0845  amino acid permease family protein  56.64 
 
 
456 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1754  amino acid permease-associated region  48.41 
 
 
474 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  36.72 
 
 
472 aa  270  4e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0159  arginine/ornithine antiporter  37.44 
 
 
478 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0163  arginine/ornithine antiporter  37.62 
 
 
478 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0422  arginine/ornithine antiporter  35.19 
 
 
471 aa  246  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4896  arginine/ornithine antiporter  35.19 
 
 
471 aa  246  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.782908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0409  arginine/ornithine antiporter  34.98 
 
 
471 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0196821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0474  arginine/ornithine antiporter  34.62 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0343  arginine-ornithine antiporter  34.98 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2683  arginine/ornithine antiporter  35.35 
 
 
475 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4385  arginine/ornithine antiporter  34.97 
 
 
475 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1671  arginine/ornithine antiporter  36.21 
 
 
475 aa  229  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2166  arginine/ornithine antiporter  32.05 
 
 
475 aa  229  9e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2247  arginine/ornithine antiporter  32.6 
 
 
467 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0350  arginine/ornithine antiporter  36.01 
 
 
471 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2851  arginine/ornithine antiporter  33.41 
 
 
468 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000722534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06670  arginine/ornithine antiporter  33.26 
 
 
480 aa  228  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.477443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4222  arginine/ornithine antiporter  34.87 
 
 
475 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2657  arginine/ornithine antiporter  33.48 
 
 
476 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2713  arginine/ornithine antiporter  33.48 
 
 
476 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1001  arginine/ornithine antiporter  35.17 
 
 
475 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2383  arginine/ornithine antiporter  32.72 
 
 
486 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.646333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0916  arginine/ornithine antiporter  32.96 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1144  arginine/ornithine antiporter  32.96 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2129  arginine/ornithine antiporter  32.96 
 
 
506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768095  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0243  arginine/ornithine antiporter  32.96 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1969  arginine/ornithine antiporter  32.96 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1988  arginine/ornithine antiporter  32.96 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4384  arginine/ornithine antiporter  33.94 
 
 
475 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.669533  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1584  arginine/ornithine antiporter  32.96 
 
 
506 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1002  arginine/ornithine antiporter  34.16 
 
 
475 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1039  arginine/ornithine antiporter  34.94 
 
 
475 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808656  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2101  arginine/ornithine antiporter  35.42 
 
 
475 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0476819  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1089  arginine/ornithine antiporter  33.33 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.505428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68300  arginine/ornithine antiporter  33.78 
 
 
482 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000378428  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4536  arginine/ornithine antiporter  32.48 
 
 
484 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5910  arginine/ornithine antiporter  33.11 
 
 
482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0569669  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2660  arginine/ornithine antiporter  33.86 
 
 
475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2391  arginine/ornithine antiporter  34.95 
 
 
471 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2065  arginine/ornithine antiporter  35.01 
 
 
475 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00119125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2315  arginine/ornithine antiporter  34.72 
 
 
471 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2127  arginine/ornithine antiporter  34.72 
 
 
475 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2061  arginine/ornithine antiporter  34.72 
 
 
475 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.111642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2281  arginine/ornithine antiporter  34.72 
 
 
475 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2307  arginine/ornithine antiporter  34.72 
 
 
475 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1109  arginine/ornithine antiporter  32.95 
 
 
475 aa  210  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.28189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4221  arginine/ornithine antiporter  32.65 
 
 
475 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2264  arginine/ornithine antiporter  34.41 
 
 
475 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2320  amino acid transporter  31.48 
 
 
526 aa  207  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5574  arginine/ornithine antiporter  32.48 
 
 
493 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3061  arginine/ornithine antiporter  34.03 
 
 
475 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1392  arginine/ornithine antiporter  31.84 
 
 
496 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.679815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1003  arginine/ornithine antiporter  32.42 
 
 
475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1040  arginine/ornithine antiporter  32.42 
 
 
480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188854  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1498  amino acid permease-associated region  31.25 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333437  normal  0.389664 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0072  amino acid permease  33.88 
 
 
671 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137456  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1484  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  33.88 
 
 
496 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0574434  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1878  arginine/ornithine APC family antiporter  33.88 
 
 
493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  31.51 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1571  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  33.88 
 
 
663 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0188747  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1002  arginine/ornithine antiporter  32.19 
 
 
475 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2423  arginine/ornithine antiporter  31.4 
 
 
489 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2906  amino acid permease-associated region  30.35 
 
 
500 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01574  predicted arginine/ornithine antiporter transporter  29.46 
 
 
460 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.424719  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2025  arginine/ornithine antiporter  29.46 
 
 
460 aa  191  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1680  putative arginine/ornithine antiporter  29.46 
 
 
460 aa  191  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.982096  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2038  arginine/ornithine antiporter  29.46 
 
 
460 aa  191  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000756362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1594  arginine/ornithine antiporter  29.46 
 
 
460 aa  191  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132259  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1813  putative arginine/ornithine antiporter  29.46 
 
 
460 aa  191  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00102354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01564  hypothetical protein  29.46 
 
 
460 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.358572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1791  arginine/ornithine antiporter  29.25 
 
 
460 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0468427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2315  arginine/ornithine antiporter  29.46 
 
 
460 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222235  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1847  arginine/ornithine antiporter  30.87 
 
 
460 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.861199  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2587  arginine/ornithine antiporter  31.79 
 
 
463 aa  187  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2905  arginine/ornithine antiporter  29.49 
 
 
473 aa  186  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3864  amino acid permease-associated region  32.27 
 
 
465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000323953  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1828  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  30.63 
 
 
463 aa  183  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.768875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>