More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1001 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1002  arginine/ornithine antiporter  97.68 
 
 		 475 aa  868    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1003  arginine/ornithine antiporter  78.41 
 
 		 475 aa  651    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1002  arginine/ornithine antiporter  78.63 
 
 		 475 aa  649    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1039  arginine/ornithine antiporter  98.32 
 
 		 475 aa  924    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1144  arginine/ornithine antiporter  81.86 
 
 		 486 aa  726    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2683  arginine/ornithine antiporter  84.84 
 
 		 475 aa  764    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2129  arginine/ornithine antiporter  81.86 
 
 		 506 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4384  arginine/ornithine antiporter  78.11 
 
 		 475 aa  708    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.669533  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4385  arginine/ornithine antiporter  91.37 
 
 		 475 aa  792    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1089  arginine/ornithine antiporter  79.53 
 
 		 493 aa  701    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.505428 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2383  arginine/ornithine antiporter  82.07 
 
 		 486 aa  741    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.646333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1988  arginine/ornithine antiporter  81.86 
 
 		 486 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4536  arginine/ornithine antiporter  77.75 
 
 		 484 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4221  arginine/ornithine antiporter  77.05 
 
 		 475 aa  669    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2660  arginine/ornithine antiporter  76 
 
 		 475 aa  675    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0916  arginine/ornithine antiporter  81.86 
 
 		 486 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68300  arginine/ornithine antiporter  84.38 
 
 		 482 aa  729    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000378428  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1109  arginine/ornithine antiporter  79.37 
 
 		 475 aa  705    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.28189 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1969  arginine/ornithine antiporter  81.86 
 
 		 486 aa  726    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4222  arginine/ornithine antiporter  94.74 
 
 		 475 aa  850    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1040  arginine/ornithine antiporter  78.41 
 
 		 480 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1001  arginine/ornithine antiporter  100 
 
 		 475 aa  933    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5910  arginine/ornithine antiporter  83.96 
 
 		 482 aa  725    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0569669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1584  arginine/ornithine antiporter  81.86 
 
 		 506 aa  727    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0243  arginine/ornithine antiporter  81.86 
 
 		 486 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1392  arginine/ornithine antiporter  60.49 
 
 		 496 aa  518  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.679815 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  53.57 
 
 		 472 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5574  arginine/ornithine antiporter  61.4 
 
 		 493 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2905  arginine/ornithine antiporter  58.32 
 
 		 473 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1878  arginine/ornithine APC family antiporter  61.71 
 
 		 493 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1484  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  59.49 
 
 		 496 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0574434  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0072  amino acid permease  59.49 
 
 		 671 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137456  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1571  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  60.04 
 
 		 663 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0188747  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2423  arginine/ornithine antiporter  55.7 
 
 		 489 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0159  arginine/ornithine antiporter  54.53 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2174  arginine/ornithine antiporter  58.28 
 
 		 492 aa  473  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0163  arginine/ornithine antiporter  54.32 
 
 		 478 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2166  arginine/ornithine antiporter  50.54 
 
 		 475 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0343  arginine-ornithine antiporter  52.85 
 
 		 471 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0422  arginine/ornithine antiporter  52.85 
 
 		 471 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0474  arginine/ornithine antiporter  52.22 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4896  arginine/ornithine antiporter  52.64 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.782908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2315  arginine/ornithine antiporter  49.26 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2391  arginine/ornithine antiporter  49.47 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2307  arginine/ornithine antiporter  50.11 
 
 		 475 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2127  arginine/ornithine antiporter  50.11 
 
 		 475 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2065  arginine/ornithine antiporter  50.11 
 
 		 475 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00119125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2061  arginine/ornithine antiporter  50.11 
 
 		 475 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.111642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2281  arginine/ornithine antiporter  50.11 
 
 		 475 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0409  arginine/ornithine antiporter  52.64 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0196821 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1671  arginine/ornithine antiporter  49.68 
 
 		 475 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2264  arginine/ornithine antiporter  50.32 
 
 		 475 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04620  amino acid transporter  52.41 
 
 		 488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0350  arginine/ornithine antiporter  51.58 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3061  arginine/ornithine antiporter  49.68 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06670  arginine/ornithine antiporter  51.16 
 
 		 480 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.477443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2101  arginine/ornithine antiporter  48.83 
 
 		 475 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0476819  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2247  arginine/ornithine antiporter  48.3 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1038  amino acid permease  54.37 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.200212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1190  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  54.37 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.430396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0019  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  54.37 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.991696  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0393  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  54.37 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2851  arginine/ornithine antiporter  48.72 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000722534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4184  amino acid permease  51.43 
 
 		 472 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2657  arginine/ornithine antiporter  48.01 
 
 		 476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48850  amino acid permease  51.43 
 
 		 472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176582  hitchhiker  0.0000000102328 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2713  arginine/ornithine antiporter  48.01 
 
 		 476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2315  arginine/ornithine antiporter  46.35 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222235  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01574  predicted arginine/ornithine antiporter transporter  46.14 
 
 		 460 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.424719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2038  arginine/ornithine antiporter  46.14 
 
 		 460 aa  398  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000756362  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01564  hypothetical protein  46.14 
 
 		 460 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.358572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1680  putative arginine/ornithine antiporter  46.14 
 
 		 460 aa  398  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.982096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1594  arginine/ornithine antiporter  46.14 
 
 		 460 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2025  arginine/ornithine antiporter  46.14 
 
 		 460 aa  398  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1813  putative arginine/ornithine antiporter  46.14 
 
 		 460 aa  398  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00102354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1791  arginine/ornithine antiporter  45.71 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0468427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1847  arginine/ornithine antiporter  49.32 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.861199  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1645  arginine/ornithine antiporter  46.45 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.498381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1586  arginine/ornithine antiporter  46.45 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916366  normal  0.560128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1697  arginine/ornithine antiporter  46.45 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1577  arginine/ornithine antiporter  46.45 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933609  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2587  arginine/ornithine antiporter  46.92 
 
 		 463 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19660  amino acid transporter  43.44 
 
 		 489 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.598137  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2298  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  46.58 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.552138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1828  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  46.58 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.768875  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0744  arginine/ornithine antiporter  45.26 
 
 		 503 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1939  arginine/ornithine antiporter  46.58 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1498  amino acid permease-associated region  45.7 
 
 		 445 aa  368  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333437  normal  0.389664 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2906  amino acid permease-associated region  42.98 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3864  amino acid permease-associated region  48.49 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000323953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3099  amino acid permease-associated region  49.02 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1278  amino acid permease-associated region  49.64 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0546125 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3089  amino acid permease-associated region  49.64 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3242  amino acid permease-associated region  49.16 
 
 		 466 aa  348  9e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2970  amino acid permease-associated region  42.12 
 
 		 494 aa  345  1e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0377  putative arginine/ornithine antiporter  40.38 
 
 		 481 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3333  amino acid permease-associated region  43.82 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11790  amino acid transporter  46.28 
 
 		 472 aa  335  7.999999999999999e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0372  arginine/ornithine antiporter  39.53 
 
 		 481 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14000  amino acid transporter  40.84 
 
 		 495 aa  326  6e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>