46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1443 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 265 aa  527  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2158  putative ABC-2 type transport system permease protein  35.88 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82128  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  32.09 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  32.09 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2157  hypothetical protein  28.57 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0455  hypothetical protein  29.06 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0190  hypothetical protein  25.66 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0456  hypothetical protein  30.58 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  26.36 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4578  putative ABC transporter, permease component  24.73 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000593867  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1185  hypothetical protein  26.1 
 
 		 268 aa  85.9  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3299  ABC transporter, permease  26.42 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3603  ABC transporter, permease protein  26.04 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6354299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3609  ABC transporter, permease protein  26.15 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3350  ABC transporter, permease  25.66 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.97912e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1616  ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  hitchhiker  0.000000421446 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3701  ABC transporter, permease protein  24.53 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000237165  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1243  hypothetical protein  28.04 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1989  hypothetical protein  25.21 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000959722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3278  ABC transporter, permease component  26.04 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00162462  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2984  hypothetical protein  24.91 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4246  hypothetical protein  22.94 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1244  hypothetical protein  24.79 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1837  hypothetical protein  23.28 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0090  ABC-2 type transporter  20.6 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1838  hypothetical protein  26.32 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3386  hypothetical protein  25.37 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0545233  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0021  CesD  20.22 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7393  hypothetical protein  20.73 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3617  ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 163 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2170  ABC transporter, permease component  22.63 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1635  hypothetical protein  24.54 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00020049  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0079  hypothetical protein  23.18 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  21.24 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  22.8 
 
 		 534 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2347  hypothetical protein  26.64 
 
 		 391 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  19.69 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  20.08 
 
 		 532 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  27.42 
 
 		 274 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3706  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease  24.75 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3699  hypothetical protein  24.75 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3371  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease  24.75 
 
 		 314 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0164571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1543  bacitracin transport permease protein bcrb  24.75 
 
 		 314 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0441008 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3772  bacitracin transport permease protein bcrb  24.75 
 
 		 314 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3420  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease component  24.24 
 
 		 314 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072807  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  21.13 
 
 		 286 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>