20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2212 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  196  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0895  XRE family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  46.77 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  38.57 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  47.62 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  37.68 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0262  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  34.72 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0102  XRE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  31.76 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1316  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  54.29 
 
 		 109 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3278  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 114 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0655244  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.71 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>