170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5776 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5776  thioesterase  100 
 
 
258 aa  530  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261382  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.63 
 
 
251 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.63 
 
 
251 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  31.05 
 
 
258 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  30.4 
 
 
252 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.36 
 
 
256 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.78 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  31.52 
 
 
271 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3863  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.33 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181058  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.21 
 
 
1337 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  25.86 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.12 
 
 
281 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  30.94 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  30.94 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  30.94 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  32.22 
 
 
280 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  31.2 
 
 
260 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  27.31 
 
 
248 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.8 
 
 
250 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  31.8 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  31.8 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  31.8 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  30.92 
 
 
259 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  32.52 
 
 
250 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  29.31 
 
 
278 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1834  thioesterase  30.41 
 
 
253 aa  105  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.80691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  27.27 
 
 
253 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  31.42 
 
 
258 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  29.87 
 
 
259 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  26.41 
 
 
278 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.02 
 
 
256 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  29.83 
 
 
254 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.83 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  27.76 
 
 
271 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  24.43 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1779  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  26.24 
 
 
239 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140397  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.34 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  30.67 
 
 
248 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3448  Thioesterase  29.72 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  30.92 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  29.41 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.44 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  22.84 
 
 
240 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.32 
 
 
291 aa  95.9  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0527  Thioesterase  30.18 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224136  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2828  thioesterase  28.75 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33270  PvdG  29.28 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275002  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3130  thioesterase  27.27 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  31.27 
 
 
2835 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  28.88 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  27.83 
 
 
255 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.34 
 
 
267 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  31.54 
 
 
2839 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  31.54 
 
 
2832 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  32.28 
 
 
2125 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  31.54 
 
 
2839 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  31.54 
 
 
2832 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  33.33 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0025  type II thioesterase, CesT  27.52 
 
 
237 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  28.76 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  30.6 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  30 
 
 
829 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  30.99 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3749  Thioesterase  28.63 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.501691  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5286  thioesterase  29.1 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0605968  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3366  thioesterase  29.1 
 
 
257 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5001  thioesterase  29.1 
 
 
257 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0435421  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5687  thioesterase  31.22 
 
 
256 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0638728 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  24.45 
 
 
250 aa  89.7  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  28.02 
 
 
247 aa  89  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  22.78 
 
 
240 aa  88.6  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1831  pyochelin biosynthetic protein  27.91 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2296  Thioesterase  32.29 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  25.62 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  27.85 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  27.87 
 
 
257 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  27.19 
 
 
1354 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  27.85 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.4 
 
 
250 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  28.57 
 
 
245 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3397  thioesterase  25.97 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.075668  normal  0.267418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  28.87 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  29.09 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  24.19 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2147  pyochelin biosynthetic protein  27.82 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00348724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  29.41 
 
 
2792 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5926  thioesterase  29.44 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.023654  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4759  thioesterase  27.71 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0873  pyochelin biosynthetic protein PchC  27.56 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0783  pyochelin biosynthetic protein PchC  27.82 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  28.87 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0630  Thioesterase  29.11 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.35 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4690  CFA synthetase, thioesterase component  26.98 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.39 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.93 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  29.68 
 
 
236 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  25.86 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3475  Thioesterase  27.55 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449577  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  30.8 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>