61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5486 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  100 
 
 
242 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  59.91 
 
 
227 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  54.58 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  55.86 
 
 
224 aa  229  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  55.19 
 
 
213 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  54.19 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  51.13 
 
 
224 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  51.58 
 
 
241 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  51.12 
 
 
244 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  47.49 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  47.03 
 
 
247 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  45.09 
 
 
231 aa  175  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  43.64 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  43.64 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  44.02 
 
 
238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  47.69 
 
 
229 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  45.7 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  42.22 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  41.96 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  37.34 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  39.38 
 
 
232 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  40.53 
 
 
231 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  43.35 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  44.19 
 
 
228 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  41.28 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  43.72 
 
 
227 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  35.45 
 
 
228 aa  121  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  40.64 
 
 
228 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1078  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4150  GCN5-related N-acetyltransferase  26.16 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1948  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.5 
 
 
151 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6861  hypothetical protein  50.88 
 
 
188 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574097  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1990  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.9 
 
 
160 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2418  GCN5-related N-acetyltransferase  35.04 
 
 
246 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  41.46 
 
 
158 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  46.43 
 
 
295 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0893  hypothetical protein  50 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
263 aa  45.4  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3838  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
269 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  35.04 
 
 
262 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1810  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000508978  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3230  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.66 
 
 
162 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0309  GCN5-related N-acetyltransferase  44.74 
 
 
169 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2252  acetyltransferase  33.87 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000131288  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1575  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  43.86 
 
 
311 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0338041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1701  GCN5-related N-acetyltransferase  25.87 
 
 
189 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4440  hypothetical protein  36.14 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00246211  decreased coverage  0.000186457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4290  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
190 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1109  putative acetyltransferase  36.21 
 
 
105 aa  42.7  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  44.74 
 
 
181 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122912 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2895  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 
281 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.446946  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2851  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 
281 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2882  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 
281 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0899618  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2515  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.06 
 
 
378 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.291701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6547  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.05 
 
 
152 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2291  GCN5-related N-acetyltransferase  39.06 
 
 
168 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101571  normal  0.149434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  31.71 
 
 
184 aa  42  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52756  N-acetyltransferase  39.06 
 
 
189 aa  42  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.978055  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.15 
 
 
153 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>