45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5325 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 61 aa  116  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  68.25 
 
 		 63 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 64 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 64 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  62.5 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  65.45 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0475  DNA binding domain protein, excisionase family  47.46 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0643  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4535  DNA binding domain protein, excisionase family  45.9 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3741  hypothetical protein  40.62 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3792  hypothetical protein  40.62 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0173  DNA binding domain protein, excisionase family  47.46 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  46.94 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  48.15 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  42.86 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  48.94 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  46.81 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1536  DNA binding domain-containing protein  46.51 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  41.51 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0435  prophage LambdaBa04, DNA binding protein  36 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000289269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0421  prophage LambdaBa04, DNA binding protein  36 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  44.68 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  48.94 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0830  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0513  DNA binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.252241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  48.94 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  46.81 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2463  DNA binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000388448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  40 
 
 		 315 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  40 
 
 		 306 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  36.54 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  40 
 
 		 315 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  38 
 
 		 315 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2977  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.467459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  38 
 
 		 306 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  38 
 
 		 306 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2142  excisionase/Xis, DNA-binding  36.36 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.276898 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  38 
 
 		 306 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  38 
 
 		 306 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1996  hypothetical protein  40.38 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 65 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>