More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5157 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  100 
 
 
474 aa  943    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  51.7 
 
 
489 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  39 
 
 
444 aa  302  9e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  41.63 
 
 
445 aa  277  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  36.67 
 
 
459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  36.12 
 
 
446 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  37.03 
 
 
460 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  36.06 
 
 
466 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  36.49 
 
 
457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  33.48 
 
 
1373 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  33.04 
 
 
1373 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  33.26 
 
 
1373 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  33.04 
 
 
1373 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  33.04 
 
 
1373 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  32.82 
 
 
1380 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  33.04 
 
 
1373 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  33.04 
 
 
1373 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  34.95 
 
 
448 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  34.29 
 
 
1365 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  37.28 
 
 
439 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  36.61 
 
 
479 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  34.38 
 
 
454 aa  236  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  34.35 
 
 
482 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  36.79 
 
 
447 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  34.41 
 
 
447 aa  230  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  34.55 
 
 
452 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  33.4 
 
 
469 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  36.22 
 
 
479 aa  226  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  33.88 
 
 
431 aa  221  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  37.37 
 
 
452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  36.47 
 
 
446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  32.59 
 
 
432 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  32.39 
 
 
433 aa  216  8e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  34.91 
 
 
473 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  33.33 
 
 
452 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  37 
 
 
468 aa  209  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  32.47 
 
 
546 aa  208  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  35.33 
 
 
461 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  34.79 
 
 
445 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  35.76 
 
 
508 aa  207  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  34.28 
 
 
462 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  32.9 
 
 
445 aa  206  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  32 
 
 
455 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  33.33 
 
 
452 aa  206  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  32.5 
 
 
459 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  31.31 
 
 
454 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  30.22 
 
 
463 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  35.19 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  27.44 
 
 
448 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  33.63 
 
 
429 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  31.5 
 
 
437 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  31.79 
 
 
441 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  33.55 
 
 
467 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  35.15 
 
 
464 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  29.38 
 
 
459 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  31.32 
 
 
451 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  34.06 
 
 
466 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  31.71 
 
 
525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  34.2 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  29.15 
 
 
455 aa  190  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  31.31 
 
 
484 aa  190  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  30.9 
 
 
454 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  30.9 
 
 
454 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  28.44 
 
 
461 aa  188  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  28.44 
 
 
495 aa  187  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  29.48 
 
 
457 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  29.48 
 
 
457 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  34.42 
 
 
440 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  28.38 
 
 
458 aa  186  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  30.22 
 
 
453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  33.5 
 
 
459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  33.62 
 
 
455 aa  183  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  33.49 
 
 
457 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  34.24 
 
 
470 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7149  P-450 monooxygenase  29.62 
 
 
456 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  31.97 
 
 
470 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  27.96 
 
 
462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  29.34 
 
 
445 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  32.38 
 
 
461 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  28.28 
 
 
467 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  33.56 
 
 
465 aa  177  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  32.43 
 
 
462 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  34.15 
 
 
484 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4834  cytochrome P450  32.93 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000050774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  27.99 
 
 
457 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  29.4 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  29.4 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  32.2 
 
 
480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  28.99 
 
 
462 aa  173  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  31.38 
 
 
430 aa  172  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  33.02 
 
 
471 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  30.72 
 
 
452 aa  172  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  32.12 
 
 
463 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  33.56 
 
 
450 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2644  cytochrome P450  33.5 
 
 
448 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  33.56 
 
 
450 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  32.54 
 
 
471 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  31.35 
 
 
460 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  32.24 
 
 
453 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  31.24 
 
 
461 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>