More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4569 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4569  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
277 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572506  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4157  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.84 
 
 
275 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70127  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.9 
 
 
271 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.91 
 
 
273 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.91 
 
 
273 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3613  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.91 
 
 
273 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.263625  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6258  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.83 
 
 
265 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.434452  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6335  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.47 
 
 
261 aa  122  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
260 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
257 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
261 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  34.1 
 
 
261 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  34.1 
 
 
261 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
266 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  33.72 
 
 
261 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 
271 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  33.72 
 
 
261 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 
797 aa  118  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
257 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
257 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  33.72 
 
 
261 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  34.87 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.92 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.12 
 
 
259 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.44 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  34 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
259 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 
257 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 
257 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 
257 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  33.33 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06235  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G03410)  36.55 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0989568  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.87 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.29 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
263 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  31.72 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.69 
 
 
257 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  31.69 
 
 
258 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
258 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
258 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 
258 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  32.95 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  32.37 
 
 
258 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.86 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  32.37 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.57 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 
268 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.54 
 
 
259 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 
264 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.18 
 
 
261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 
257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.04 
 
 
260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.57 
 
 
297 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
261 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  32.57 
 
 
261 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  32.57 
 
 
261 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
261 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  32.57 
 
 
297 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.44 
 
 
260 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
261 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.31 
 
 
262 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
265 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
265 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
260 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.1 
 
 
262 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 
258 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 
258 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
249 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
261 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
249 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  32.18 
 
 
261 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
249 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
258 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  31.28 
 
 
264 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>