More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3672 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3672  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
323 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7645  oxidoreductase  42.42 
 
 
309 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0449  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.92 
 
 
310 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.275954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.67 
 
 
325 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3845  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.73 
 
 
307 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.334803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4423  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.35 
 
 
303 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.601642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4425  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.31 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.320539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4574  oxidoreductase  33.84 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.561951  normal  0.180256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.18 
 
 
306 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2004  alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.084826  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.12 
 
 
332 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.68 
 
 
332 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.12 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.37 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  24.12 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
326 aa  86.3  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.82 
 
 
332 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.37 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.31 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.24 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6510  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.09 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.267083 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1020  quinone oxidoreductase  27.1 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.740068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.47 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.37 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.4 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1586  alcohol dehydrogenase  39.78 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.02 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.54 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  25.08 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6140  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.81 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  33.04 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.69 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.92 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.38 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4700  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.34 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1545  alcohol dehydrogenase  27.8 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0146504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4983  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.64 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.07 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.46 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  32.06 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  24.58 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.15 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  33.47 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.09 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.08 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.58 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.6 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.68 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.94 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.05 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.27 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.4 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  27.97 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0270  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.12 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.974154  normal  0.251208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.93 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.05 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.49 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.15 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.31 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2330  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.56 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700885  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1823  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.81 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2379  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.89 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.61 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1409  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395097  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.8 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3963  NADPH:quinone reductase  36.56 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.7 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.01 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  29.64 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  29.22 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  29.64 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3403  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.15 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.046263  normal  0.0678818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1657  alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000320474  normal  0.0104238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5695  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.97 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.77 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3909  alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0317152 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002527  NADPH:quinone reductase  25 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0639  alcohol dehydrogenase  26.6 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000239851  hitchhiker  0.000149204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.15 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0783  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.98 
 
 
347 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.96 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3227  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.73 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659744  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7251  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.93 
 
 
300 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  30.43 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>