More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3612 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
430 aa  843    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  46.85 
 
 
414 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  42.55 
 
 
401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  43.75 
 
 
416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  42.56 
 
 
421 aa  282  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  43.04 
 
 
413 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  38.32 
 
 
397 aa  223  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  36.65 
 
 
402 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  40.17 
 
 
403 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  36.36 
 
 
402 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  37.41 
 
 
412 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  37.62 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  37.38 
 
 
399 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  35.53 
 
 
402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  35.43 
 
 
397 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  36 
 
 
402 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  34.31 
 
 
400 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  38.19 
 
 
404 aa  193  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  35.21 
 
 
396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  35.88 
 
 
402 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  34.65 
 
 
397 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  34.65 
 
 
397 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  34.65 
 
 
397 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  34.65 
 
 
397 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  34.74 
 
 
397 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  41.85 
 
 
412 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  36.13 
 
 
401 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  35.62 
 
 
402 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  40.1 
 
 
400 aa  186  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  32.98 
 
 
397 aa  186  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  34.22 
 
 
400 aa  186  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  36.48 
 
 
399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  37.31 
 
 
395 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  32.55 
 
 
403 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  37.92 
 
 
394 aa  177  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  36.46 
 
 
395 aa  176  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  37.86 
 
 
397 aa  176  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  39.78 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  33.62 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  36.43 
 
 
414 aa  173  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  36.43 
 
 
414 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  34.15 
 
 
396 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  36.71 
 
 
395 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  34.38 
 
 
398 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
410 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  37.17 
 
 
420 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  33.43 
 
 
377 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  35.89 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  37.31 
 
 
399 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  35.52 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  31.57 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  37.06 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  33.83 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  36.87 
 
 
398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  33.07 
 
 
400 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  34.83 
 
 
402 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  35.43 
 
 
385 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  37.93 
 
 
407 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  33.25 
 
 
421 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  33.42 
 
 
404 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 
389 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.47 
 
 
404 aa  153  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  33.98 
 
 
387 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.92 
 
 
426 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  28 
 
 
422 aa  150  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
444 aa  149  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  31.42 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  37.4 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  30.17 
 
 
459 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  32.46 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  32.55 
 
 
404 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  31.07 
 
 
378 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  31.12 
 
 
384 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  33.93 
 
 
373 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  31.08 
 
 
401 aa  143  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  30.38 
 
 
384 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  32.34 
 
 
422 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  32.09 
 
 
404 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  32.84 
 
 
385 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  30.2 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  33.23 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  29.43 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  29.9 
 
 
711 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  30.22 
 
 
382 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  30.33 
 
 
401 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.75 
 
 
411 aa  140  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08200  conserved hypothetical protein  30.88 
 
 
448 aa  139  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54635  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  31.79 
 
 
405 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  31.3 
 
 
404 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  33.03 
 
 
385 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  33.03 
 
 
385 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  32.73 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  30.36 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  32.02 
 
 
402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  29.67 
 
 
382 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  31.55 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  30.54 
 
 
386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  30.85 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  30.85 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>