39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2076 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2076  putative lipoprotein  100 
 
 
276 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128092  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3752  putative lipoprotein  49.2 
 
 
250 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1194  putative lipoprotein  45.31 
 
 
280 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1101  putative lipoprotein  45.31 
 
 
280 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3486  putative lipoprotein  47.1 
 
 
271 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1273  putative lipoprotein  45.63 
 
 
282 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.958512 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1964  putative lipoprotein  44.36 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0700691  hitchhiker  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6128  putative lipoprotein  48.24 
 
 
305 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2411  hypothetical protein  44.05 
 
 
246 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2330  putative lipoprotein  41.04 
 
 
244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0461141  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1144  putative lipoprotein  44.06 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4640  putative lipoprotein  43.08 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0160  putative lipoprotein  46.18 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2178  hypothetical protein  33.87 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0247  hypothetical protein  69.23 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1051  2-phosphosulfolactate phosphatase  20.87 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00427368  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1552  2-phosphosulfolactate phosphatase  28.76 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0129  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.2 
 
 
227 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.774772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0131  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.8 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2138  2-phosphosulfolactate phosphatase  32.2 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.506693  normal  0.243415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1805  2-phosphosulfolactate phosphatase  28.57 
 
 
249 aa  55.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191126  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06701  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.21 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.284053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0750  2-phosphosulfolactate phosphatase  30.19 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.158423  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0597  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.74 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.543467  normal  0.916156 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0539  2-phosphosulfolactate phosphatase  28.63 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0119  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.42 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.809928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1570  2-phosphosulfolactate phosphatase  28.99 
 
 
240 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10351  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.27 
 
 
244 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal  0.507461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0407  2-phosphosulfolactate phosphatase  24.58 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.932789  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3249  hypothetical protein  27.69 
 
 
244 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2444  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.57 
 
 
269 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000651389  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1487  2-phosphosulfolactate phosphatase  22.78 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2128  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.83 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.219665  normal  0.271835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1515  2-phosphosulfolactate phosphatase  22.78 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.302384  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4415  2-phosphosulfolactate phosphatase  24.6 
 
 
236 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587802  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2076  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.63 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0614  2-phosphosulfolactate phosphatase  22.57 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0040  2-phosphosulfolactate phosphatase  22.92 
 
 
241 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4549  2-phosphosulfolactate phosphatase  21.51 
 
 
236 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>