147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2009 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2009  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2252  hypothetical protein  55.56 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4092  hypothetical protein  53.33 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681938  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2033  hypothetical protein  50.66 
 
 		 231 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2079  hypothetical protein  50.66 
 
 		 231 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.601553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2016  hypothetical protein  50.22 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.892245  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  37.02 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  39.39 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  39.5 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0175  protein of unknown function DUF427  38.02 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  35 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  32.31 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11074  hypothetical protein  46.98 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0277375  normal  0.0429341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  33.91 
 
 		 265 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4720  hypothetical protein  35.53 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5108  hypothetical protein  39.22 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5196  hypothetical protein  39.22 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5487  hypothetical protein  39.22 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3249  hypothetical protein  29.69 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  37.29 
 
 		 130 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  42.62 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  44.44 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  35.34 
 
 		 120 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  37.93 
 
 		 120 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  35.71 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  37.74 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  38.98 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  36.79 
 
 		 130 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  35.19 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  34.4 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  32.46 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  32.46 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  32.17 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  35.4 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  34.55 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0198  hypothetical protein  40.91 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.057512  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0473  hypothetical protein  35.85 
 
 		 147 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374421  normal  0.0376651 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  37.61 
 
 		 125 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  32.14 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  37.04 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  37.04 
 
 		 124 aa  72  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  34.75 
 
 		 165 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 		 132 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0640  hypothetical protein  34 
 
 		 113 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  39.58 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  34.21 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  36.46 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  32.41 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  33.05 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  33.03 
 
 		 118 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  34.74 
 
 		 118 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  32.2 
 
 		 165 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  31.62 
 
 		 132 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  35.19 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  34.91 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  31.19 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  34.95 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  34.95 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  33.03 
 
 		 126 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  31.36 
 
 		 165 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  31.36 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  34.86 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3071  hypothetical protein  39.76 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711545  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  38.18 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  38.18 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2920  protein of unknown function DUF427  33.58 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000166616  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  38.18 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  31.62 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  33.64 
 
 		 123 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  33.64 
 
 		 123 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  38.1 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0677  hypothetical protein  33.02 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782308  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  38.1 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  38.1 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  33.64 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0684  hypothetical protein  32.38 
 
 		 119 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.835024  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1974  hypothetical protein  38.55 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  31.91 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0682  hypothetical protein  38.55 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  27.97 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  28.57 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2990  hypothetical protein  27.27 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3034  hypothetical protein  27.27 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  31.62 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  34 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2534  hypothetical protein  31.43 
 
 		 119 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975897  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2661  hypothetical protein  31.43 
 
 		 119 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2004  hypothetical protein  30.48 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.515923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2614  hypothetical protein  30.48 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.899878  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  29.46 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2643  hypothetical protein  30.48 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  31.4 
 
 		 517 aa  55.5  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11076  DUF427 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02220)  29.59 
 
 		 100 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2074  hypothetical protein  34.69 
 
 		 102 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.915864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>