More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1665 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1178  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 		 950 aa  649    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0144635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1665  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 937 aa  1851    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175798  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  40.02 
 
 		 897 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3137  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 866 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00387942  normal  0.129618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 1297 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  28.95 
 
 		 1317 aa  320  7e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  28.17 
 
 		 1336 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  32.22 
 
 		 7712 aa  315  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  32.34 
 
 		 2365 aa  313  6.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  28.33 
 
 		 1331 aa  310  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  29.66 
 
 		 6661 aa  308  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  30.31 
 
 		 2386 aa  307  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  29.62 
 
 		 1345 aa  303  9e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  29.9 
 
 		 2883 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  31.12 
 
 		 2386 aa  301  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  29.45 
 
 		 1334 aa  300  7e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  30.91 
 
 		 2385 aa  299  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  30.69 
 
 		 1315 aa  299  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.48 
 
 		 2385 aa  297  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.66 
 
 		 2385 aa  297  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  28.36 
 
 		 5596 aa  296  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.77 
 
 		 2385 aa  296  9e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.77 
 
 		 2385 aa  296  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  27.28 
 
 		 1436 aa  296  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.92 
 
 		 1336 aa  296  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1439 aa  293  9e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  30.08 
 
 		 1363 aa  292  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  27.23 
 
 		 888 aa  290  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  29.43 
 
 		 3291 aa  289  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  34.09 
 
 		 4489 aa  289  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 634 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.811397  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.28 
 
 		 4531 aa  283  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  30.31 
 
 		 6676 aa  283  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  31.23 
 
 		 6403 aa  281  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  26.53 
 
 		 2151 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6556  siderophore 2,3-dihydroxybenzoate (DHB) synthesis protein  31.29 
 
 		 1305 aa  275  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416947  hitchhiker  0.00000457979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  32.34 
 
 		 1344 aa  273  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1593  non-ribosomal peptide synthase  31.61 
 
 		 1346 aa  269  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1213  peptide synthetase-like protein  31.19 
 
 		 1320 aa  268  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.29 
 
 		 2385 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  30.57 
 
 		 5929 aa  267  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  29.62 
 
 		 2385 aa  266  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.62 
 
 		 2385 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  30.31 
 
 		 1383 aa  266  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3693  amino acid adenylation domain protein  31.34 
 
 		 2274 aa  265  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.29 
 
 		 2385 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.2 
 
 		 5953 aa  264  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0187  syringopeptin synthetase C  32.91 
 
 		 1345 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1675  CtaG  32.78 
 
 		 1353 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  31.57 
 
 		 1304 aa  262  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0746  enterobactin synthase subunit F  29.82 
 
 		 1294 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  33.29 
 
 		 8211 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0700  enterobactin synthase subunit F  29.79 
 
 		 1294 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  30.62 
 
 		 2877 aa  261  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  33.25 
 
 		 1296 aa  261  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0627  enterobactin synthase subunit F  29.95 
 
 		 1294 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0641  enterobactin synthase subunit F  29.82 
 
 		 1294 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0684  enterobactin synthase subunit F  29.94 
 
 		 1294 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.885796 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  29.79 
 
 		 1314 aa  257  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0365  thioesterase  42.57 
 
 		 361 aa  255  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.387154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  29.2 
 
 		 1282 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  28.77 
 
 		 3432 aa  253  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  29.96 
 
 		 2352 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  28.7 
 
 		 2752 aa  253  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  29.97 
 
 		 2855 aa  252  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  29.92 
 
 		 4520 aa  252  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2429  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.33 
 
 		 1160 aa  251  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336894  hitchhiker  0.00172605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1119  enterobactin synthase subunit F  28.11 
 
 		 1290 aa  251  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  27.17 
 
 		 4960 aa  251  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  27.94 
 
 		 1369 aa  251  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0606  enterobactin synthase subunit F  28.67 
 
 		 1293 aa  251  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  32.22 
 
 		 1356 aa  250  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  28.61 
 
 		 1069 aa  250  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  30 
 
 		 4991 aa  250  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  29.56 
 
 		 3328 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  28.12 
 
 		 1833 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  29.37 
 
 		 6006 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  29.56 
 
 		 3352 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  29.37 
 
 		 6072 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  29.66 
 
 		 6081 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  30.01 
 
 		 13537 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  29.4 
 
 		 1325 aa  249  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  31.57 
 
 		 1525 aa  248  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  30.49 
 
 		 1518 aa  248  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  28.22 
 
 		 1310 aa  248  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  28.68 
 
 		 3942 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1678  amino acid adenylation domain protein  28.85 
 
 		 1393 aa  247  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  28.94 
 
 		 2875 aa  247  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  31.25 
 
 		 3761 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0671  enterobactin synthase subunit F  28.18 
 
 		 1293 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  29.55 
 
 		 5926 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00553  enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP-dependent  28.04 
 
 		 1293 aa  245  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00542  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1293 aa  245  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0422505  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3040  amino acid adenylation domain protein  28.13 
 
 		 1293 aa  245  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3058  enterobactin synthase subunit F  28.06 
 
 		 1293 aa  245  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0606  enterobactin synthase subunit F  28.06 
 
 		 1293 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0636  enterobactin synthase subunit F  28.13 
 
 		 1293 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0488  enterobactin synthase subunit F  27.95 
 
 		 1293 aa  244  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0995  amino acid adenylation domain-containing protein  25.92 
 
 		 1284 aa  242  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.966277  hitchhiker  0.000000137922 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6474  amino acid adenylation domain-containing protein  31.42 
 
 		 1304 aa  243  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.571102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>