47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1644 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1644  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 276 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826883  normal  0.0558565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0382  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0319  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03630  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.21 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415883  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5769  alpha/beta hydrolase fold protein  38.06 
 
 		 248 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8230  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6771  flavin reductase-like, FMN-binding  34.44 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  40.86 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 		 319 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  25.61 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  35 
 
 		 327 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.04 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  31.69 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 308 aa  45.4  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  33.61 
 
 		 494 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  35.78 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  26.14 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.78 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 		 373 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.84 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  32.14 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 		 313 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 317 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 277 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.2 
 
 		 380 aa  42.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  27.32 
 
 		 248 aa  42.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 317 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 317 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>